More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5355 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1411 aa  2912    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.34 
 
 
1193 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.42 
 
 
1188 aa  549  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  30.79 
 
 
1213 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.15 
 
 
1221 aa  539  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 
1190 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.35 
 
 
1196 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.94 
 
 
1208 aa  503  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 
1247 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.79 
 
 
1209 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1188 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.7 
 
 
1557 aa  365  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  33.24 
 
 
1474 aa  363  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 
1443 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.74 
 
 
1652 aa  334  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  35.45 
 
 
696 aa  327  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.05 
 
 
1163 aa  324  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.41 
 
 
1363 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.49 
 
 
1236 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  33.6 
 
 
1553 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.83 
 
 
1481 aa  309  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.89 
 
 
947 aa  302  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.02 
 
 
1357 aa  301  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.91 
 
 
1523 aa  301  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.1 
 
 
1364 aa  299  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.73 
 
 
1789 aa  295  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 
1552 aa  295  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  34.02 
 
 
1510 aa  293  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.77 
 
 
1686 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.52 
 
 
919 aa  292  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
1831 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30.87 
 
 
1211 aa  280  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.84 
 
 
1711 aa  272  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.48 
 
 
1454 aa  270  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.73 
 
 
1901 aa  266  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.19 
 
 
1661 aa  261  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.56 
 
 
1609 aa  260  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.78 
 
 
1217 aa  259  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.22 
 
 
1262 aa  255  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.09 
 
 
1868 aa  253  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.56 
 
 
930 aa  252  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.94 
 
 
1229 aa  252  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
1760 aa  251  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.05 
 
 
1583 aa  251  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.07 
 
 
1176 aa  251  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.54 
 
 
1367 aa  249  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 
1190 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.97 
 
 
1177 aa  245  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.44 
 
 
1607 aa  244  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 
1348 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 
1656 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 
1766 aa  241  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.59 
 
 
1599 aa  241  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.16 
 
 
1547 aa  240  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.82 
 
 
1161 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 
1161 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 
1807 aa  234  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.73 
 
 
1626 aa  231  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.78 
 
 
1209 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.98 
 
 
1598 aa  231  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.31 
 
 
1240 aa  227  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.19 
 
 
924 aa  226  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.31 
 
 
664 aa  221  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.56 
 
 
1267 aa  218  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  32.98 
 
 
1714 aa  218  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  38.08 
 
 
344 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.28 
 
 
740 aa  218  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.16 
 
 
1344 aa  217  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.83 
 
 
1623 aa  215  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.51 
 
 
1878 aa  214  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.97 
 
 
1684 aa  214  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  33.77 
 
 
1599 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.85 
 
 
1858 aa  213  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.6 
 
 
1373 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.16 
 
 
676 aa  211  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.57 
 
 
1617 aa  211  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  42.56 
 
 
742 aa  210  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  35.99 
 
 
344 aa  206  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.79 
 
 
677 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.68 
 
 
1164 aa  202  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.74 
 
 
1416 aa  201  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  39.67 
 
 
434 aa  200  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.16 
 
 
630 aa  198  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  26.98 
 
 
1264 aa  198  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  26.11 
 
 
608 aa  198  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  26.98 
 
 
1264 aa  198  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 
1334 aa  196  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  29.53 
 
 
505 aa  195  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  24.47 
 
 
1330 aa  193  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.97 
 
 
576 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 
1304 aa  189  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.5 
 
 
1242 aa  189  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
1279 aa  189  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.81 
 
 
737 aa  189  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  35.48 
 
 
652 aa  188  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  24.25 
 
 
1427 aa  188  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  37.54 
 
 
774 aa  187  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 
565 aa  187  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
1279 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  43.15 
 
 
284 aa  187  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>