More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3379 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  100 
 
 		 1242 aa  2571    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  55.15 
 
 		 1330 aa  1350    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.89 
 
 		 1205 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  35.79 
 
 		 1523 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.65 
 
 		 1363 aa  366  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  33.75 
 
 		 1454 aa  363  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  34.32 
 
 		 1367 aa  358  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.38 
 
 		 1652 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.15 
 
 		 696 aa  355  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 		 1163 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.03 
 
 		 1557 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1229 aa  348  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.21 
 
 		 1236 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 		 947 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.67 
 
 		 1831 aa  326  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 1221 aa  317  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.32 
 
 		 1364 aa  317  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1474 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.57 
 
 		 1868 aa  303  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.5 
 
 		 1262 aa  303  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1211 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.11 
 
 		 1188 aa  297  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31 
 
 		 1213 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.36 
 
 		 919 aa  296  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1552 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.7 
 
 		 1481 aa  293  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.88 
 
 		 930 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1510 aa  289  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.79 
 
 		 1196 aa  287  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 		 1686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.12 
 
 		 1553 aa  286  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.98 
 
 		 1193 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.6 
 
 		 1609 aa  274  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  32.65 
 
 		 1247 aa  274  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.02 
 
 		 1357 aa  271  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.25 
 
 		 1901 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.77 
 
 		 1656 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.5 
 
 		 1598 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 		 1711 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31 
 
 		 1626 aa  262  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.14 
 
 		 1760 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  31.38 
 
 		 1443 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.58 
 
 		 1599 aa  257  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 728 aa  255  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1789 aa  253  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.79 
 
 		 1607 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1190 aa  247  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 		 1188 aa  247  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.56 
 
 		 1217 aa  244  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.48 
 
 		 1416 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 1208 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.37 
 
 		 1684 aa  240  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.99 
 
 		 1856 aa  239  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 		 1547 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.22 
 
 		 1583 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1807 aa  233  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 		 1348 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1161 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.88 
 
 		 1280 aa  230  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 		 1161 aa  229  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.88 
 
 		 1617 aa  228  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 		 1164 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.69 
 
 		 1209 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1214 aa  221  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1209 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.4 
 
 		 924 aa  219  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1491 aa  218  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.12 
 
 		 1484 aa  217  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.06 
 
 		 1661 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.02 
 
 		 1240 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1344 aa  215  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 505 aa  214  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.99 
 
 		 676 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 		 1623 aa  211  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.96 
 
 		 1766 aa  211  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 		 1878 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.93 
 
 		 1267 aa  207  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.01 
 
 		 677 aa  205  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  40.43 
 
 		 742 aa  204  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.34 
 
 		 740 aa  204  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.3 
 
 		 642 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  35.74 
 
 		 657 aa  203  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1176 aa  202  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.88 
 
 		 608 aa  199  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1097 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.77 
 
 		 576 aa  196  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  37.63 
 
 		 344 aa  195  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  37.98 
 
 		 434 aa  194  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.58 
 
 		 1039 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 1311 aa  191  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.68 
 
 		 565 aa  189  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  41.44 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  32.87 
 
 		 464 aa  189  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.37 
 
 		 664 aa  189  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1041 aa  188  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  36.68 
 
 		 344 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  42.41 
 
 		 540 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.07 
 
 		 1411 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  29.4 
 
 		 1399 aa  184  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>