More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3455 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  34.27 
 
 		 1242 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  33.2 
 
 		 1330 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  100 
 
 		 1205 aa  2398    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.73 
 
 		 1523 aa  326  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.51 
 
 		 1454 aa  291  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1196 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.04 
 
 		 1652 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.07 
 
 		 696 aa  278  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 		 1363 aa  277  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.8 
 
 		 1868 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.89 
 
 		 947 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 1221 aa  268  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.02 
 
 		 1163 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.16 
 
 		 1262 aa  263  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1474 aa  259  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.65 
 
 		 1443 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.5 
 
 		 1364 aa  250  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.19 
 
 		 1236 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.42 
 
 		 1193 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.98 
 
 		 1188 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1510 aa  238  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 		 1686 aa  234  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 1831 aa  233  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.24 
 
 		 1557 aa  232  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1553 aa  232  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 1807 aa  227  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.68 
 
 		 1481 aa  227  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1367 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1190 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1229 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1214 aa  223  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 1213 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.63 
 
 		 1901 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.31 
 
 		 1416 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1211 aa  214  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 1656 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30 
 
 		 1280 aa  211  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1789 aa  207  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.41 
 
 		 919 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.51 
 
 		 1217 aa  201  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.32 
 
 		 1357 aa  199  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.03 
 
 		 1247 aa  198  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 505 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.38 
 
 		 930 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 		 1760 aa  192  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 1711 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.23 
 
 		 1188 aa  191  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 		 1208 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.39 
 
 		 1684 aa  187  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 		 728 aa  187  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.98 
 
 		 1856 aa  185  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.36 
 
 		 1161 aa  186  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  32.6 
 
 		 1484 aa  185  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 		 1161 aa  184  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.75 
 
 		 1823 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.68 
 
 		 924 aa  181  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.58 
 
 		 1617 aa  181  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.59 
 
 		 1598 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 		 1344 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.17 
 
 		 1348 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 		 1164 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1661 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1491 aa  172  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 		 1607 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.19 
 
 		 1209 aa  172  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.5 
 
 		 1609 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1552 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.41 
 
 		 1583 aa  168  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.59 
 
 		 1599 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.02 
 
 		 1626 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.06 
 
 		 608 aa  160  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1858 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 		 1177 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.21 
 
 		 657 aa  158  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  22.07 
 
 		 1311 aa  157  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 		 1190 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.19 
 
 		 677 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1097 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 		 1878 aa  155  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 		 778 aa  155  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.18 
 
 		 545 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.42 
 
 		 578 aa  154  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.54 
 
 		 676 aa  152  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.57 
 
 		 554 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.71 
 
 		 740 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.03 
 
 		 1547 aa  147  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1714 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.14 
 
 		 742 aa  146  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.34 
 
 		 1267 aa  145  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  29.87 
 
 		 545 aa  145  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 589 aa  144  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1477 aa  144  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 565 aa  144  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1304 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  30.38 
 
 		 344 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.02 
 
 		 1411 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.38 
 
 		 344 aa  142  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 687 aa  141  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  28.19 
 
 		 774 aa  141  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  30.74 
 
 		 316 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>