More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2489 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 565 aa  1092    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  46.92 
 
 		 608 aa  435  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1789 aa  339  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  37.54 
 
 		 1523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.47 
 
 		 696 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  35.34 
 
 		 1364 aa  289  1e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.07 
 
 		 1711 aa  283  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  33.09 
 
 		 1236 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.17 
 
 		 1163 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.4 
 
 		 1686 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  33.63 
 
 		 1510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.45 
 
 		 1652 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.69 
 
 		 1363 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.4 
 
 		 1553 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  35.27 
 
 		 1454 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1196 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 1221 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.39 
 
 		 1481 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.12 
 
 		 947 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  34.44 
 
 		 1656 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.02 
 
 		 1661 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 		 1557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  33.39 
 
 		 1714 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 1760 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  33.27 
 
 		 1831 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 1161 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 1161 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1190 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.18 
 
 		 1188 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.41 
 
 		 1193 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1367 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  36.03 
 
 		 1217 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  36.33 
 
 		 1357 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1474 aa  230  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.94 
 
 		 919 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.51 
 
 		 1807 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.62 
 
 		 1901 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.61 
 
 		 1868 aa  227  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.43 
 
 		 1262 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1176 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.42 
 
 		 930 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 		 1348 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.25 
 
 		 1609 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.21 
 
 		 1247 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.44 
 
 		 1552 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.43 
 
 		 1164 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1766 aa  211  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  34.37 
 
 		 1599 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1229 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.99 
 
 		 1214 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.32 
 
 		 1599 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.16 
 
 		 1583 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 		 1213 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  31.71 
 
 		 1209 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.52 
 
 		 1208 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.52 
 
 		 1684 aa  200  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.98 
 
 		 1416 aa  200  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1211 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.39 
 
 		 1626 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.7 
 
 		 740 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.81 
 
 		 1190 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.3 
 
 		 1240 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.09 
 
 		 728 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.91 
 
 		 1858 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.79 
 
 		 1373 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  33.09 
 
 		 1443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.33 
 
 		 1242 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  38.31 
 
 		 344 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.83 
 
 		 1607 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.73 
 
 		 1617 aa  190  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.31 
 
 		 1177 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1411 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.07 
 
 		 924 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.74 
 
 		 676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.85 
 
 		 1547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  36.51 
 
 		 344 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.71 
 
 		 1598 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  33.57 
 
 		 464 aa  183  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.35 
 
 		 1280 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1016 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1016 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.82 
 
 		 1344 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.82 
 
 		 677 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.14 
 
 		 1188 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.94 
 
 		 576 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  40.69 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.45 
 
 		 316 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.49 
 
 		 317 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  33.9 
 
 		 316 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.76 
 
 		 1334 aa  174  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 1311 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.62 
 
 		 1330 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  31.82 
 
 		 1100 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  32.19 
 
 		 316 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  35.07 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  30.8 
 
 		 316 aa  167  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.52 
 
 		 1823 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.92 
 
 		 1623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31.47 
 
 		 316 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>