More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3823 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50 
 
 
1583 aa  1361    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.13 
 
 
1607 aa  1238    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.38 
 
 
1609 aa  1295    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.5 
 
 
1599 aa  1150    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.95 
 
 
1598 aa  1435    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  53.01 
 
 
1190 aa  942    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.15 
 
 
1398 aa  1107    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.77 
 
 
1267 aa  720    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50.93 
 
 
1547 aa  1371    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 
1078 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  48.66 
 
 
1046 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.94 
 
 
1684 aa  1121    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
1617 aa  3160    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  47.28 
 
 
1032 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.27 
 
 
1623 aa  1103    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  45.33 
 
 
972 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  50 
 
 
1626 aa  1363    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  50.12 
 
 
1013 aa  661    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  46.78 
 
 
973 aa  628  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  45.16 
 
 
969 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  45.05 
 
 
969 aa  625  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  45.15 
 
 
897 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
965 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
1014 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 
1005 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  43.2 
 
 
1020 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
1085 aa  554  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.92 
 
 
1553 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.49 
 
 
1236 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.27 
 
 
1686 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.43 
 
 
1823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.95 
 
 
1357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.3 
 
 
1711 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  40.98 
 
 
1367 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 
1760 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.23 
 
 
1240 aa  443  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.93 
 
 
1557 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
698 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.43 
 
 
1652 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.58 
 
 
1163 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 
1491 aa  387  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.07 
 
 
1363 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  35.92 
 
 
1229 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.07 
 
 
1481 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.95 
 
 
947 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  34.78 
 
 
1552 aa  370  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.01 
 
 
1344 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  35.49 
 
 
1510 aa  370  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  34.73 
 
 
1789 aa  364  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  36.07 
 
 
1523 aa  352  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.49 
 
 
1364 aa  351  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  38.02 
 
 
696 aa  350  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.34 
 
 
1196 aa  344  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.97 
 
 
1656 aa  339  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.77 
 
 
1221 aa  337  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.85 
 
 
1211 aa  335  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  36.24 
 
 
1454 aa  334  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.57 
 
 
1262 aa  331  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  49.87 
 
 
947 aa  331  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.81 
 
 
1161 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.66 
 
 
1161 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  32.38 
 
 
1661 aa  324  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
1831 aa  324  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  32.25 
 
 
1193 aa  321  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.09 
 
 
1868 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.18 
 
 
1164 aa  314  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.19 
 
 
1188 aa  311  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
1474 aa  310  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 
1334 aa  306  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  34.97 
 
 
1353 aa  305  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 
1714 aa  299  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  34.63 
 
 
1100 aa  296  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 
1247 aa  295  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.18 
 
 
1190 aa  295  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
1314 aa  294  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  32.99 
 
 
1416 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.31 
 
 
930 aa  291  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.84 
 
 
1901 aa  290  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.12 
 
 
1072 aa  288  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.7 
 
 
1072 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.97 
 
 
919 aa  286  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 
728 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
1443 aa  280  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  35.13 
 
 
1766 aa  279  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.06 
 
 
1076 aa  278  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  38.92 
 
 
1217 aa  278  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 
1807 aa  275  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 
1213 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.37 
 
 
1304 aa  267  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  30.66 
 
 
505 aa  266  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  35.07 
 
 
1214 aa  263  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.98 
 
 
924 aa  261  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  26.86 
 
 
1265 aa  260  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.77 
 
 
1399 aa  260  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.39 
 
 
1858 aa  258  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.22 
 
 
1176 aa  258  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.29 
 
 
1348 aa  255  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
1016 aa  251  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 
1177 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  53.97 
 
 
425 aa  248  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>