More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1225 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.35 
 
 
1598 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
897 aa  1776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  47.14 
 
 
1020 aa  751    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  46.69 
 
 
1046 aa  646    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  94.73 
 
 
969 aa  1572    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  47.81 
 
 
1005 aa  760    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  48.27 
 
 
1014 aa  764    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  53.87 
 
 
972 aa  808    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  94.41 
 
 
969 aa  1573    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  97.2 
 
 
965 aa  1571    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  46.85 
 
 
1547 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  56.42 
 
 
1078 aa  915    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.78 
 
 
1607 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.98 
 
 
1398 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
1032 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  47.26 
 
 
1085 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  54.81 
 
 
973 aa  862    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  53.93 
 
 
947 aa  810    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.61 
 
 
1190 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  47.54 
 
 
1013 aa  632  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.74 
 
 
1599 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49.11 
 
 
1623 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.84 
 
 
1617 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  43.76 
 
 
1626 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.61 
 
 
1609 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.36 
 
 
1684 aa  618  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.94 
 
 
1583 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  51 
 
 
698 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 
1353 aa  322  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.78 
 
 
1823 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.5 
 
 
1267 aa  300  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 
1314 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  50.18 
 
 
425 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.13 
 
 
1152 aa  210  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  35.76 
 
 
1157 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
1152 aa  204  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
985 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  31.81 
 
 
1308 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  34.8 
 
 
1344 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.3 
 
 
822 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
894 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 
557 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  29.37 
 
 
1073 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.14 
 
 
943 aa  181  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 
1240 aa  180  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.7 
 
 
681 aa  175  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.75 
 
 
1044 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34 
 
 
825 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
597 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
862 aa  174  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.01 
 
 
642 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 
455 aa  174  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.49 
 
 
1023 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.97 
 
 
757 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  42.86 
 
 
963 aa  173  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
531 aa  171  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  37 
 
 
700 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  34.04 
 
 
672 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
562 aa  170  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.27 
 
 
902 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.14 
 
 
736 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.48 
 
 
1686 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 
821 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
891 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  37.83 
 
 
1053 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.04 
 
 
798 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  32.06 
 
 
1699 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
646 aa  168  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.1 
 
 
740 aa  168  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.97 
 
 
664 aa  167  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
691 aa  167  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 
1334 aa  167  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
938 aa  167  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
915 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  33.71 
 
 
625 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.59 
 
 
645 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
599 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  39.21 
 
 
642 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  36.24 
 
 
919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.36 
 
 
601 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.35 
 
 
520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 
1711 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 
625 aa  165  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.64 
 
 
647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  37.3 
 
 
1057 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
557 aa  164  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.7 
 
 
676 aa  164  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.06 
 
 
769 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  30.58 
 
 
1265 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
651 aa  163  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  38.54 
 
 
412 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
653 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.66 
 
 
650 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  36.7 
 
 
650 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  32.7 
 
 
614 aa  162  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  34.63 
 
 
661 aa  163  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
575 aa  161  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>