More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4408 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  38.21 
 
 
1190 aa  757    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.18 
 
 
1163 aa  805    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  41.28 
 
 
1161 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  41.37 
 
 
1161 aa  817    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  45.08 
 
 
1209 aa  991    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  64.94 
 
 
1176 aa  1598    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.47 
 
 
1367 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  100 
 
 
1177 aa  2407    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  39.48 
 
 
1164 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  37.97 
 
 
891 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  42.34 
 
 
1789 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  39.15 
 
 
1661 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.3 
 
 
1711 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.86 
 
 
1686 aa  496  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  38.9 
 
 
1714 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  51.34 
 
 
902 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  51.34 
 
 
902 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  35.68 
 
 
1363 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  37.5 
 
 
1652 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.3 
 
 
1348 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.06 
 
 
1760 aa  429  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  34.98 
 
 
1552 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  52.53 
 
 
1914 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.19 
 
 
1236 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.66 
 
 
1656 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  46.67 
 
 
1477 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.63 
 
 
947 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  53.53 
 
 
1908 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  50.93 
 
 
1932 aa  390  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  38.72 
 
 
1523 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  39.53 
 
 
696 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.03 
 
 
1196 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  37.28 
 
 
1510 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  39.72 
 
 
1553 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  49.73 
 
 
2077 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.33 
 
 
1481 aa  361  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.33 
 
 
1221 aa  360  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.84 
 
 
1373 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  50.53 
 
 
781 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  36.24 
 
 
1858 aa  352  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  35.54 
 
 
1193 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.8 
 
 
1557 aa  345  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  39.44 
 
 
1364 aa  342  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  37.71 
 
 
1454 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.04 
 
 
1188 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 
335 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  36.35 
 
 
1247 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.26 
 
 
1609 aa  325  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.28 
 
 
1868 aa  318  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.1 
 
 
1583 aa  318  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.56 
 
 
1607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.12 
 
 
1190 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.8 
 
 
919 aa  312  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.59 
 
 
1357 aa  311  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  38.59 
 
 
1599 aa  302  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.06 
 
 
1626 aa  302  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.25 
 
 
1213 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.74 
 
 
1217 aa  301  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  32.5 
 
 
1766 aa  301  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.78 
 
 
1547 aa  298  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  27.35 
 
 
1279 aa  297  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  33.39 
 
 
1229 aa  297  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.02 
 
 
1016 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  33.03 
 
 
1474 aa  295  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 
1279 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.56 
 
 
1901 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 
1016 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.07 
 
 
1598 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.66 
 
 
1262 aa  288  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 
1304 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.15 
 
 
1344 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.6 
 
 
1684 aa  280  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.37 
 
 
1807 aa  280  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
1831 aa  280  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1264 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.72 
 
 
1599 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 
1264 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
1443 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  31.5 
 
 
1208 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  40.62 
 
 
787 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.75 
 
 
1617 aa  265  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.56 
 
 
930 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.93 
 
 
1623 aa  262  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  32.84 
 
 
1211 aa  258  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.97 
 
 
1411 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.89 
 
 
1267 aa  241  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.11 
 
 
608 aa  240  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.14 
 
 
1240 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.67 
 
 
740 aa  235  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  36.44 
 
 
1214 aa  228  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.97 
 
 
1416 aa  226  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.21 
 
 
924 aa  224  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.28 
 
 
1823 aa  222  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.87 
 
 
1188 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  37.31 
 
 
376 aa  218  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  40.23 
 
 
344 aa  218  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.48 
 
 
1856 aa  216  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 
1209 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  28.39 
 
 
1399 aa  214  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 
1491 aa  214  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>