29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1813 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  100 
 
 		 376 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  39.89 
 
 		 902 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  39.89 
 
 		 902 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  38.32 
 
 		 1190 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.08 
 
 		 1163 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  38.1 
 
 		 1161 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  38.1 
 
 		 1161 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  37.47 
 
 		 2077 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  38.06 
 
 		 1477 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 		 1914 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  37.31 
 
 		 1177 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  37.96 
 
 		 1164 aa  215  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  37.28 
 
 		 1367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  37.43 
 
 		 1908 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  37.18 
 
 		 781 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  36.57 
 
 		 1176 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  36.32 
 
 		 1209 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  36.88 
 
 		 891 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 		 1932 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  32.82 
 
 		 787 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 		 1214 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  29.83 
 
 		 870 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  29.81 
 
 		 854 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1353  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 864 aa  86.7  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  23.2 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  22.25 
 
 		 500 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2930  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1964 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>