More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2738 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.59 
 
 		 1809 aa  884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.02 
 
 		 1663 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.5 
 
 		 2109 aa  735    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  43.98 
 
 		 2051 aa  1246    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  39.3 
 
 		 2361 aa  1178    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.84 
 
 		 1780 aa  1213    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.55 
 
 		 1901 aa  1270    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.6 
 
 		 1805 aa  1047    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  40.46 
 
 		 1934 aa  1181    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.8 
 
 		 1804 aa  1179    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.81 
 
 		 2017 aa  1108    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  39.81 
 
 		 1794 aa  1106    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  44.18 
 
 		 1850 aa  1269    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.13 
 
 		 1797 aa  1143    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.23 
 
 		 1795 aa  1152    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.8 
 
 		 1808 aa  1184    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.54 
 
 		 1797 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.86 
 
 		 1885 aa  777    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.22 
 
 		 1836 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 		 1908 aa  1171    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.96 
 
 		 1774 aa  941    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  31.68 
 
 		 1833 aa  937    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  37.49 
 
 		 1914 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.28 
 
 		 1822 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  32.35 
 
 		 1837 aa  882    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  32.45 
 
 		 2272 aa  818    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 2077 aa  4244    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 		 1942 aa  1253    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  39.36 
 
 		 1811 aa  1070    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  41.19 
 
 		 1805 aa  1118    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  41.46 
 
 		 1932 aa  1124    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  32.52 
 
 		 2279 aa  809    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.75 
 
 		 1845 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.52 
 
 		 1780 aa  818    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 1644 aa  744    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.15 
 
 		 1668 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 		 1871 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.61 
 
 		 1922 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.74 
 
 		 1712 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  32.46 
 
 		 2303 aa  788    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  45.06 
 
 		 670 aa  615  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.02 
 
 		 1123 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.92 
 
 		 1685 aa  560  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.87 
 
 		 1685 aa  556  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.73 
 
 		 1697 aa  523  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.22 
 
 		 1788 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.08 
 
 		 1832 aa  512  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.11 
 
 		 1885 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  28.74 
 
 		 1739 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.93 
 
 		 1748 aa  476  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.69 
 
 		 1756 aa  462  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.36 
 
 		 1710 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.72 
 
 		 1629 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 		 1636 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.17 
 
 		 1685 aa  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 1637 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  52.16 
 
 		 1190 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.03 
 
 		 1643 aa  393  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  52.91 
 
 		 1367 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.74 
 
 		 1682 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.83 
 
 		 1682 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  26.33 
 
 		 1060 aa  386  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.86 
 
 		 1064 aa  385  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  27.92 
 
 		 1112 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 1726 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  50.55 
 
 		 902 aa  384  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  50.55 
 
 		 902 aa  384  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  49.18 
 
 		 1163 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  50.96 
 
 		 781 aa  370  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  51.25 
 
 		 891 aa  366  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  49.73 
 
 		 1177 aa  363  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  48 
 
 		 1176 aa  363  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  50 
 
 		 1164 aa  360  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  48.63 
 
 		 1161 aa  351  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  48.63 
 
 		 1161 aa  351  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  46.07 
 
 		 1209 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  53.19 
 
 		 335 aa  348  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  46.7 
 
 		 1477 aa  347  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  25.9 
 
 		 1123 aa  328  8.000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  23.75 
 
 		 1649 aa  317  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  21.99 
 
 		 1473 aa  297  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  21.99 
 
 		 1473 aa  297  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.07 
 
 		 1473 aa  297  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  22.53 
 
 		 1744 aa  288  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  41.08 
 
 		 787 aa  276  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  23.72 
 
 		 1255 aa  255  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  36.19 
 
 		 1214 aa  236  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  37.47 
 
 		 376 aa  224  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  25.04 
 
 		 900 aa  210  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1304 aa  202  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  21.39 
 
 		 2312 aa  199  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  21.13 
 
 		 1377 aa  192  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  21.97 
 
 		 1086 aa  178  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 494 aa  167  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  23.68 
 
 		 1774 aa  162  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 		 1344 aa  161  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  23.56 
 
 		 1015 aa  159  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 739 aa  157  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 1741 aa  150  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.46 
 
 		 627 aa  143  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>