More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0230 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  76.72 
 
 
1682 aa  2616    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  35.09 
 
 
1710 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
1685 aa  3424    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.29 
 
 
1697 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  76.52 
 
 
1682 aa  2607    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  36.48 
 
 
1744 aa  949    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.11 
 
 
1712 aa  612  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.99 
 
 
1845 aa  586  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.44 
 
 
1663 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.38 
 
 
1668 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  29.63 
 
 
1809 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.27 
 
 
1833 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.81 
 
 
1685 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.8 
 
 
1837 aa  550  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.08 
 
 
1685 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.08 
 
 
1748 aa  539  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.95 
 
 
1780 aa  536  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.55 
 
 
1822 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.96 
 
 
1795 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.62 
 
 
2051 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.83 
 
 
1836 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.77 
 
 
1805 aa  496  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
1908 aa  496  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.72 
 
 
1804 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.39 
 
 
1808 aa  486  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.93 
 
 
1794 aa  479  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.18 
 
 
1901 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.52 
 
 
1850 aa  462  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.08 
 
 
1797 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 
1805 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
1914 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  27.88 
 
 
1922 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.08 
 
 
1932 aa  445  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.41 
 
 
1774 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.4 
 
 
1811 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  26.39 
 
 
2361 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  27.46 
 
 
2279 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.08 
 
 
1934 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.5 
 
 
2272 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.75 
 
 
2303 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.93 
 
 
1871 aa  394  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
1942 aa  390  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.04 
 
 
1780 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.95 
 
 
1885 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.17 
 
 
2077 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.62 
 
 
2109 aa  355  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.86 
 
 
1885 aa  352  4e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.52 
 
 
2017 aa  351  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1644 aa  315  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.26 
 
 
1788 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.05 
 
 
1756 aa  272  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
1637 aa  266  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 
670 aa  247  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.79 
 
 
1739 aa  246  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
1123 aa  245  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 
1636 aa  245  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.51 
 
 
1797 aa  215  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
427 aa  211  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  22.73 
 
 
1112 aa  193  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
470 aa  184  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152454  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
470 aa  184  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
1629 aa  183  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
640 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
1649 aa  173  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 
1643 aa  172  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
963 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
739 aa  162  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.09 
 
 
1064 aa  161  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  35.44 
 
 
406 aa  160  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
729 aa  159  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
636 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
495 aa  158  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
494 aa  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  25 
 
 
900 aa  155  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
733 aa  155  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
875 aa  155  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
779 aa  154  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
1000 aa  154  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.17 
 
 
1832 aa  151  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
902 aa  150  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
1211 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
632 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
632 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
632 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
498 aa  150  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  28.55 
 
 
1726 aa  150  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
773 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
975 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
845 aa  148  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
538 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  36.36 
 
 
358 aa  148  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
978 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  36.02 
 
 
635 aa  147  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
748 aa  146  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
484 aa  146  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.59 
 
 
1473 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
759 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  34.33 
 
 
357 aa  144  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  23.68 
 
 
1473 aa  144  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  23.68 
 
 
1473 aa  144  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>