More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4716 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 1644 aa  764    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 1942 aa  1275    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.09 
 
 		 1712 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  39.12 
 
 		 1914 aa  1068    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  47.56 
 
 		 670 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.75 
 
 		 2303 aa  828    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  34.86 
 
 		 1809 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  42.57 
 
 		 2077 aa  1162    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.36 
 
 		 2109 aa  811    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1739 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.49 
 
 		 2361 aa  1199    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.43 
 
 		 1780 aa  1536    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.58 
 
 		 1901 aa  1561    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  40.64 
 
 		 1805 aa  1280    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  43.57 
 
 		 1934 aa  1207    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.95 
 
 		 1804 aa  1414    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.39 
 
 		 2017 aa  1125    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  41.45 
 
 		 1794 aa  1312    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.74 
 
 		 1922 aa  933    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  46.7 
 
 		 1850 aa  1575    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.63 
 
 		 1797 aa  1395    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.12 
 
 		 1795 aa  1392    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  100 
 
 		 1808 aa  3713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  36.38 
 
 		 2279 aa  903    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.3 
 
 		 1822 aa  784    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  33.94 
 
 		 1833 aa  902    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.71 
 
 		 1668 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.17 
 
 		 1797 aa  786    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  42.24 
 
 		 1932 aa  1170    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.92 
 
 		 1663 aa  787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  41.8 
 
 		 1805 aa  1147    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 1908 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.71 
 
 		 1836 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.28 
 
 		 1845 aa  867    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 1123 aa  817    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  43.63 
 
 		 2051 aa  1354    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.38 
 
 		 1697 aa  752    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  35.06 
 
 		 1837 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  42.18 
 
 		 1811 aa  1375    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.48 
 
 		 1871 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.99 
 
 		 1780 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  35.28 
 
 		 2272 aa  857    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.97 
 
 		 1774 aa  1052    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.87 
 
 		 1685 aa  596  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.65 
 
 		 1685 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.38 
 
 		 1885 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  25.8 
 
 		 1756 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.68 
 
 		 1748 aa  529  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.5 
 
 		 1744 aa  529  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.45 
 
 		 1788 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.67 
 
 		 1832 aa  520  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.39 
 
 		 1685 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.5 
 
 		 1710 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 1637 aa  482  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.78 
 
 		 1682 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 1629 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.51 
 
 		 1682 aa  463  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 494 aa  449  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 1636 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  28.77 
 
 		 1112 aa  417  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 		 1726 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.99 
 
 		 1064 aa  361  7e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.65 
 
 		 1060 aa  355  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.27 
 
 		 1123 aa  344  7e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  48.19 
 
 		 641 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.34 
 
 		 699 aa  330  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.69 
 
 		 1473 aa  321  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.82 
 
 		 468 aa  321  7.999999999999999e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.3 
 
 		 688 aa  318  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 1473 aa  316  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 1473 aa  316  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 537 aa  312  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.15 
 
 		 594 aa  311  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 920 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 1072 aa  305  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 		 1649 aa  305  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  46.42 
 
 		 468 aa  303  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 715 aa  302  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 		 971 aa  302  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 1036 aa  295  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 928 aa  294  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.3 
 
 		 440 aa  293  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  49.84 
 
 		 458 aa  292  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 439 aa  290  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  51.27 
 
 		 591 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 675 aa  288  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 585 aa  280  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 680 aa  279  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  51.22 
 
 		 468 aa  278  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 		 437 aa  275  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 551 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 407 aa  268  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 470 aa  267  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.72 
 
 		 390 aa  261  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 		 443 aa  256  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  43.3 
 
 		 708 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  41.49 
 
 		 726 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  42.32 
 
 		 730 aa  244  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  23.18 
 
 		 1255 aa  241  6.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>