More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2428 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
1942 aa  900    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.87 
 
 
1685 aa  760    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  31.12 
 
 
2272 aa  793    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.55 
 
 
2279 aa  775    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  33.03 
 
 
1885 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.21 
 
 
1780 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  100 
 
 
1837 aa  3723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.1 
 
 
2361 aa  896    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  37.58 
 
 
1780 aa  992    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.21 
 
 
1901 aa  892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.28 
 
 
1805 aa  872    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  32.13 
 
 
1934 aa  956    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  47.68 
 
 
1668 aa  1276    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.07 
 
 
1804 aa  889    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.94 
 
 
2017 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.51 
 
 
1794 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.08 
 
 
1850 aa  892    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.55 
 
 
1797 aa  867    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.73 
 
 
1795 aa  897    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.06 
 
 
1808 aa  862    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.58 
 
 
1748 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  48.66 
 
 
1833 aa  1674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  42.72 
 
 
1697 aa  1125    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  45.33 
 
 
1822 aa  1457    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  58.76 
 
 
1809 aa  2100    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  34.74 
 
 
1914 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 
2077 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  49.66 
 
 
1836 aa  1697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1644 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  46.99 
 
 
1663 aa  1258    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.95 
 
 
1922 aa  755    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  36.12 
 
 
1908 aa  881    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  37.95 
 
 
2051 aa  941    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  32.3 
 
 
1811 aa  818    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 
1805 aa  960    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  42.68 
 
 
1712 aa  1118    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
1932 aa  961    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.4 
 
 
2109 aa  679    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  36.03 
 
 
1685 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  62.51 
 
 
1845 aa  2219    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.49 
 
 
2303 aa  792    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.76 
 
 
1774 aa  817    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.67 
 
 
1871 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.39 
 
 
1797 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  31.92 
 
 
1744 aa  609  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.95 
 
 
1739 aa  592  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.58 
 
 
1788 aa  592  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  30.8 
 
 
1685 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30.67 
 
 
1682 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  30.4 
 
 
1682 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 
670 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.94 
 
 
1710 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.82 
 
 
1885 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.88 
 
 
1756 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.83 
 
 
1832 aa  486  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
1637 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
1636 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
1643 aa  440  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
1629 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
1123 aa  390  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
1726 aa  380  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 
1649 aa  305  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  28.98 
 
 
1112 aa  293  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.9 
 
 
1064 aa  266  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 
1473 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 
1473 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  25.21 
 
 
1473 aa  248  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 
851 aa  246  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.47 
 
 
1123 aa  237  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  26.22 
 
 
1060 aa  233  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
515 aa  232  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
739 aa  229  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 
657 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
636 aa  215  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
1000 aa  215  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
733 aa  213  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 
495 aa  212  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
773 aa  211  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
975 aa  211  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
632 aa  211  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
632 aa  211  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
632 aa  211  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  46.15 
 
 
356 aa  210  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
640 aa  210  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
713 aa  206  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
666 aa  206  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
875 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
759 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
886 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  42.86 
 
 
406 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
803 aa  202  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  46.82 
 
 
225 aa  201  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
662 aa  201  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
963 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
427 aa  199  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  42.44 
 
 
355 aa  198  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
748 aa  198  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
845 aa  196  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
729 aa  196  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
779 aa  196  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>