143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50614 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  40.67 
 
 
1112 aa  804    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  40.47 
 
 
1255 aa  792    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  100 
 
 
1123 aa  2328    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.95 
 
 
1797 aa  353  8.999999999999999e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  26.88 
 
 
2051 aa  353  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  27.58 
 
 
1934 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 
1908 aa  341  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.89 
 
 
1901 aa  337  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.34 
 
 
1850 aa  337  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
1942 aa  334  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.27 
 
 
1808 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.51 
 
 
1805 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  26.3 
 
 
1805 aa  313  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.38 
 
 
1780 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 
1932 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  25.9 
 
 
2077 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.16 
 
 
1795 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  27.57 
 
 
1922 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.02 
 
 
1804 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.12 
 
 
2361 aa  305  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.7 
 
 
1833 aa  295  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.76 
 
 
1794 aa  291  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.02 
 
 
1914 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.65 
 
 
1811 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.74 
 
 
2017 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  24.64 
 
 
1871 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.29 
 
 
2109 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.42 
 
 
1774 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.27 
 
 
2303 aa  257  9e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.53 
 
 
1064 aa  251  4e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.69 
 
 
2272 aa  249  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.17 
 
 
2279 aa  245  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.88 
 
 
1845 aa  240  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.99 
 
 
1809 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 
1644 aa  237  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  24.76 
 
 
1712 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  22.82 
 
 
1060 aa  236  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.79 
 
 
1780 aa  235  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  24 
 
 
1885 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  23.35 
 
 
1697 aa  231  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.79 
 
 
1663 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.18 
 
 
1668 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.47 
 
 
1837 aa  220  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.92 
 
 
1739 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.52 
 
 
1822 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  23.55 
 
 
1836 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.33 
 
 
1797 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  24.32 
 
 
900 aa  186  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
670 aa  175  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  21.78 
 
 
1744 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.49 
 
 
1885 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  22.83 
 
 
1473 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.74 
 
 
1473 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.74 
 
 
1473 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  21.54 
 
 
1685 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  22.92 
 
 
1685 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  21.49 
 
 
1685 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  20.54 
 
 
1086 aa  132  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 
1637 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  23.34 
 
 
1710 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  22.4 
 
 
1636 aa  127  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  23.17 
 
 
1015 aa  126  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  23.8 
 
 
1788 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  21.47 
 
 
1756 aa  121  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.81 
 
 
1123 aa  118  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 
1643 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.11 
 
 
1832 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
1726 aa  106  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  20.88 
 
 
1629 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.59 
 
 
1748 aa  101  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.08 
 
 
1682 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.37 
 
 
1682 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 
1649 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.75 
 
 
2312 aa  84.7  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 
1446 aa  82  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  22.93 
 
 
1022 aa  73.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  23.1 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  24.33 
 
 
1193 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.77 
 
 
1190 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  24.32 
 
 
1118 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.82 
 
 
1403 aa  65.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  26.06 
 
 
966 aa  62.4  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
1297 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  29.61 
 
 
937 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.37 
 
 
862 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  24.61 
 
 
1054 aa  58.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  22.37 
 
 
1320 aa  58.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.23 
 
 
1160 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  24.35 
 
 
723 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.22 
 
 
1080 aa  56.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  25.5 
 
 
900 aa  55.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  25.89 
 
 
1089 aa  55.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.69 
 
 
1081 aa  55.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  23.41 
 
 
998 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  22.95 
 
 
1346 aa  55.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.48 
 
 
1148 aa  55.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  22.71 
 
 
982 aa  55.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  20.95 
 
 
1005 aa  54.7  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.13 
 
 
1151 aa  54.7  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
895 aa  54.3  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>