More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1630 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 1089 aa  2139    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  49.12 
 
 		 1139 aa  917    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  33.99 
 
 		 1163 aa  303  9e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.19 
 
 		 1029 aa  204  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.52 
 
 		 1067 aa  196  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.44 
 
 		 1055 aa  181  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  31.38 
 
 		 1143 aa  165  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 		 1013 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.33 
 
 		 713 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 1193 aa  149  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.48 
 
 		 1034 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 494 aa  145  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.12 
 
 		 1126 aa  142  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 1116 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 1190 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.19 
 
 		 1075 aa  126  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  28 
 
 		 1083 aa  118  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1118 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  28.86 
 
 		 1109 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  28.26 
 
 		 647 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  28.38 
 
 		 647 aa  108  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 648 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  36.88 
 
 		 992 aa  107  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.26 
 
 		 1826 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 1216 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.69 
 
 		 954 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  29.55 
 
 		 996 aa  97.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.54 
 
 		 916 aa  96.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 981 aa  96.3  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 		 900 aa  93.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 992 aa  93.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1118 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 1235 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  26.62 
 
 		 983 aa  92  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 1064 aa  91.3  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 1015 aa  87  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.39 
 
 		 1044 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  31.5 
 
 		 957 aa  86.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.11 
 
 		 1141 aa  84.7  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.91 
 
 		 1056 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 1050 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 1022 aa  83.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  28.03 
 
 		 862 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 895 aa  81.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  27.29 
 
 		 1121 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  30.71 
 
 		 963 aa  80.1  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.48 
 
 		 1080 aa  79.7  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 		 999 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.73 
 
 		 1122 aa  79.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.63 
 
 		 967 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.27 
 
 		 1007 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.9 
 
 		 1005 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 723 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.76 
 
 		 1133 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.92 
 
 		 1006 aa  76.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  27.31 
 
 		 867 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.66 
 
 		 1123 aa  75.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.51 
 
 		 1081 aa  74.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.34 
 
 		 959 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 947 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 881 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 956 aa  73.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.86 
 
 		 964 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 1217 aa  72.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.7 
 
 		 561 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  25.9 
 
 		 1123 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.11 
 
 		 1149 aa  71.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.24 
 
 		 937 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 		 1148 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 		 1094 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 919 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  24.38 
 
 		 919 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 973 aa  71.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.68 
 
 		 993 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  24.38 
 
 		 919 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  24.94 
 
 		 1644 aa  70.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25.23 
 
 		 2361 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1353 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.56 
 
 		 1836 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.02 
 
 		 1264 aa  70.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2645  SARP family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 819 aa  69.3  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.65 
 
 		 1666 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 1403 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  31.56 
 
 		 937 aa  68.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.57 
 
 		 1134 aa  67.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.69 
 
 		 1403 aa  67.4  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 261 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 		 998 aa  67.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 		 1360 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.9 
 
 		 2109 aa  67.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 1013 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.93 
 
 		 1914 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  23.97 
 
 		 1142 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.06 
 
 		 1055 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.63 
 
 		 2051 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.21 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.78 
 
 		 1014 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>