More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5349 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 900 aa  1751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 973 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 954 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 1013 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 967 aa  349  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  32.01 
 
 		 959 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 1084 aa  236  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 		 1005 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.15 
 
 		 1006 aa  220  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 992 aa  217  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  35.66 
 
 		 981 aa  193  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 982 aa  193  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 993 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 970 aa  162  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  35.2 
 
 		 1054 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  35.99 
 
 		 967 aa  138  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 1118 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  35 
 
 		 1029 aa  134  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.66 
 
 		 1175 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 953 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  34.52 
 
 		 1051 aa  127  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.32 
 
 		 1141 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30.05 
 
 		 1132 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.86 
 
 		 1067 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  34.67 
 
 		 937 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 		 1105 aa  114  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.07 
 
 		 1029 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 1022 aa  111  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 723 aa  111  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 1403 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.84 
 
 		 1666 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 		 998 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.23 
 
 		 1422 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 1015 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  32.69 
 
 		 1123 aa  107  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.62 
 
 		 1080 aa  107  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.24 
 
 		 1075 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 1198 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.19 
 
 		 1121 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 947 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.68 
 
 		 1685 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 966 aa  104  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.78 
 
 		 1160 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.15 
 
 		 1712 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  29.98 
 
 		 1377 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 1744 aa  103  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.71 
 
 		 2272 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.42 
 
 		 1126 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 		 867 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 1020 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.91 
 
 		 1081 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.44 
 
 		 1148 aa  102  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.28 
 
 		 1034 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 		 932 aa  101  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1429 aa  101  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.74 
 
 		 2279 aa  101  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 		 1148 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.51 
 
 		 1150 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1682 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.08 
 
 		 1794 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 		 1037 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.04 
 
 		 2303 aa  99.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 1048 aa  99.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 1141 aa  99  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.9 
 
 		 1013 aa  98.6  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  32.73 
 
 		 963 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  29.53 
 
 		 1183 aa  97.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.56 
 
 		 1122 aa  97.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.94 
 
 		 1227 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 1311 aa  97.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 		 1914 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.33 
 
 		 713 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.2 
 
 		 1138 aa  95.9  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.72 
 
 		 1668 aa  95.9  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.99 
 
 		 1682 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  29.9 
 
 		 956 aa  95.1  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30.23 
 
 		 862 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 895 aa  94.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 		 1046 aa  94.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29 
 
 		 1114 aa  94.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.23 
 
 		 1780 aa  94.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.89 
 
 		 1663 aa  94.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  25.43 
 
 		 1809 aa  94  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 		 1139 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 1383 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.22 
 
 		 864 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.87 
 
 		 1139 aa  92.8  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.48 
 
 		 1845 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.71 
 
 		 1833 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.24 
 
 		 1123 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.64 
 
 		 1089 aa  92.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.6 
 
 		 1134 aa  91.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 		 1142 aa  92  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 1942 aa  92  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 		 1055 aa  92  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.2 
 
 		 1934 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>