More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0744 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  100 
 
 
1054 aa  2041    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  54.96 
 
 
1029 aa  942    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  49.62 
 
 
1051 aa  855    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  34.03 
 
 
1022 aa  174  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  35.12 
 
 
1118 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.64 
 
 
1150 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 
900 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  33.86 
 
 
1123 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  37.6 
 
 
954 aa  152  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.62 
 
 
1132 aa  151  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0735  hypothetical protein  84.21 
 
 
112 aa  152  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0480212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.68 
 
 
1121 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 
982 aa  147  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 
983 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  34.42 
 
 
1071 aa  144  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  34.9 
 
 
1198 aa  141  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.77 
 
 
1123 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  33.13 
 
 
1114 aa  140  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.93 
 
 
723 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 
981 aa  135  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 
1013 aa  135  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
973 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 
1015 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.96 
 
 
1029 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 
970 aa  131  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 
967 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.49 
 
 
992 aa  128  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
895 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  29.7 
 
 
1090 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  31.39 
 
 
1036 aa  118  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.18 
 
 
1067 aa  117  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
1227 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.58 
 
 
1774 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.21 
 
 
2017 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 
932 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
1942 aa  114  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.34 
 
 
1805 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.84 
 
 
1006 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25 
 
 
1808 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  30.55 
 
 
1055 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  32.98 
 
 
916 aa  112  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  36.95 
 
 
1161 aa  111  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.29 
 
 
2109 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  28.49 
 
 
938 aa  110  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.2 
 
 
1871 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.89 
 
 
1934 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.74 
 
 
2272 aa  108  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.6 
 
 
1118 aa  108  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.16 
 
 
1797 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
1105 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 
966 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 
1005 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  32.02 
 
 
1118 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  29.09 
 
 
1141 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.9 
 
 
1141 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.94 
 
 
2279 aa  105  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.09 
 
 
1141 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.09 
 
 
1141 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  31.34 
 
 
1153 aa  105  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  28.81 
 
 
1850 aa  105  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30 
 
 
1780 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
1403 aa  104  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.58 
 
 
1780 aa  104  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.47 
 
 
1080 aa  104  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  31.27 
 
 
1685 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  27.77 
 
 
1885 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.25 
 
 
2051 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.68 
 
 
1795 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.37 
 
 
1089 aa  103  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 
993 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 
1116 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  31.27 
 
 
1685 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  31.32 
 
 
967 aa  101  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 
959 aa  101  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  25.29 
 
 
1811 aa  101  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 
1908 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.81 
 
 
1081 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.27 
 
 
1141 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.79 
 
 
2303 aa  99.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.11 
 
 
1666 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.82 
 
 
1118 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 
1123 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
1402 aa  97.8  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.54 
 
 
1809 aa  97.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.2 
 
 
1175 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.43 
 
 
1148 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  37.1 
 
 
1053 aa  96.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.38 
 
 
1134 aa  96.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.34 
 
 
1122 aa  97.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.68 
 
 
2361 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 
1914 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.92 
 
 
1075 aa  96.3  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  30.45 
 
 
964 aa  96.3  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.88 
 
 
1794 aa  95.9  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25 
 
 
1020 aa  95.9  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
881 aa  95.1  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
670 aa  94.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.1 
 
 
1126 aa  94.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
1398 aa  94  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.46 
 
 
1291 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>