More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4503 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.23 
 
 
1712 aa  731    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.44 
 
 
1663 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.28 
 
 
1668 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  35.3 
 
 
1922 aa  910    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  33.9 
 
 
1809 aa  836    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.03 
 
 
1871 aa  750    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.37 
 
 
2051 aa  1267    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.33 
 
 
2361 aa  1202    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.38 
 
 
1780 aa  1481    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  48.37 
 
 
1901 aa  1790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  53.79 
 
 
1805 aa  1786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  52.28 
 
 
1934 aa  1539    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  34.36 
 
 
1837 aa  845    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  53.56 
 
 
1804 aa  1903    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.42 
 
 
2017 aa  1511    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  57.66 
 
 
1794 aa  2083    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  49.02 
 
 
1850 aa  1746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  100 
 
 
1797 aa  3709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  60.08 
 
 
1795 aa  2144    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.63 
 
 
1808 aa  1379    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.79 
 
 
1885 aa  788    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.19 
 
 
1739 aa  649    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.36 
 
 
2109 aa  781    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  40.13 
 
 
2077 aa  1117    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  30.45 
 
 
1836 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
1644 aa  762    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.22 
 
 
1797 aa  700    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  39.66 
 
 
1805 aa  1120    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.52 
 
 
2303 aa  801    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53 
 
 
1942 aa  1545    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  62.05 
 
 
670 aa  870    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.65 
 
 
1697 aa  730    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 
1908 aa  1186    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  34.66 
 
 
2272 aa  798    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.97 
 
 
1833 aa  978    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  38.45 
 
 
1914 aa  1024    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.55 
 
 
1822 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.41 
 
 
1845 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.52 
 
 
1774 aa  1047    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
1932 aa  1127    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.09 
 
 
1780 aa  929    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  34.13 
 
 
2279 aa  813    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
1123 aa  715    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  45.53 
 
 
1811 aa  1537    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.86 
 
 
1685 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.93 
 
 
1685 aa  558  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.13 
 
 
1832 aa  525  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.26 
 
 
1788 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.39 
 
 
1748 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.94 
 
 
1885 aa  490  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  25.87 
 
 
1756 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
1744 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.08 
 
 
1685 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.32 
 
 
1710 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.03 
 
 
1682 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  29.05 
 
 
1112 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.72 
 
 
1682 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 
1637 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.54 
 
 
1629 aa  379  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 
1643 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
1636 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.11 
 
 
1064 aa  370  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.84 
 
 
1060 aa  365  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.95 
 
 
1123 aa  353  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
494 aa  354  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
1726 aa  342  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  52.49 
 
 
342 aa  318  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
1649 aa  317  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
1072 aa  311  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  53.71 
 
 
437 aa  304  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
680 aa  299  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.25 
 
 
1473 aa  299  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.25 
 
 
1473 aa  299  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.17 
 
 
1473 aa  296  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
920 aa  291  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.97 
 
 
443 aa  289  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 
715 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.75 
 
 
431 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.21 
 
 
439 aa  286  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 
594 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
641 aa  280  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
928 aa  278  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  25.46 
 
 
1255 aa  278  8e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.29 
 
 
699 aa  278  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
1036 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.56 
 
 
591 aa  274  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  49.29 
 
 
407 aa  273  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.33 
 
 
437 aa  272  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.25 
 
 
688 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
675 aa  271  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  46.96 
 
 
468 aa  268  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  47.35 
 
 
458 aa  267  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 
585 aa  261  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
468 aa  259  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
971 aa  259  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  47.5 
 
 
468 aa  258  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  25.31 
 
 
900 aa  254  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
551 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 
440 aa  252  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
537 aa  252  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>