More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4642 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  71.38 
 
 		 1643 aa  2172    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  72.74 
 
 		 1636 aa  2281    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  64.03 
 
 		 1726 aa  1971    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  46.8 
 
 		 1756 aa  1132    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  76.02 
 
 		 1649 aa  2295    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1629 aa  3244    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  73.81 
 
 		 1637 aa  2271    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  43.82 
 
 		 1788 aa  1115    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.29 
 
 		 1780 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  28.66 
 
 		 2051 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.94 
 
 		 1808 aa  476  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.01 
 
 		 2361 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1914 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 1932 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 		 1908 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.68 
 
 		 1774 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.99 
 
 		 1780 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.74 
 
 		 1805 aa  446  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  28.15 
 
 		 1833 aa  439  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.48 
 
 		 1837 aa  440  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.03 
 
 		 1934 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.05 
 
 		 1804 aa  440  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.45 
 
 		 1845 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.05 
 
 		 1901 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.9 
 
 		 2279 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  28.32 
 
 		 1922 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  24.59 
 
 		 1850 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.73 
 
 		 2272 aa  424  1e-117  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 1644 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  25.72 
 
 		 1811 aa  416  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  24.93 
 
 		 2077 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.17 
 
 		 1809 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.67 
 
 		 1797 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.01 
 
 		 2109 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.42 
 
 		 1795 aa  403  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 1942 aa  403  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.1 
 
 		 1668 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.39 
 
 		 2303 aa  399  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.2 
 
 		 1712 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.68 
 
 		 1836 aa  400  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.73 
 
 		 1663 aa  400  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.92 
 
 		 2017 aa  396  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.49 
 
 		 1697 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.18 
 
 		 1805 aa  363  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.86 
 
 		 1822 aa  357  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.38 
 
 		 1794 aa  348  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.25 
 
 		 1871 aa  343  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 670 aa  329  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.11 
 
 		 1797 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.77 
 
 		 1885 aa  317  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.23 
 
 		 1832 aa  315  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.28 
 
 		 1682 aa  277  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.48 
 
 		 1682 aa  268  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.56 
 
 		 1685 aa  261  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.07 
 
 		 1685 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.73 
 
 		 1710 aa  248  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  31.78 
 
 		 1739 aa  235  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.93 
 
 		 1885 aa  232  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 1744 aa  220  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.82 
 
 		 1748 aa  211  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.98 
 
 		 1685 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 1235 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3783  sensory transduction system, regulatory protein  44.59 
 
 		 546 aa  166  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  45.88 
 
 		 410 aa  165  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  48.72 
 
 		 422 aa  165  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  42.65 
 
 		 346 aa  164  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 462 aa  162  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  43.43 
 
 		 344 aa  162  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 462 aa  161  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  44.64 
 
 		 538 aa  160  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  25.63 
 
 		 1774 aa  160  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  39.9 
 
 		 641 aa  156  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  45.81 
 
 		 339 aa  155  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48 
 
 		 352 aa  155  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0310  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 340 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 313 aa  154  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  45.45 
 
 		 327 aa  154  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  41.97 
 
 		 1034 aa  153  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.46 
 
 		 330 aa  153  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0313  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 340 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0308  diguanylate cyclase  41.41 
 
 		 340 aa  152  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0314  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 340 aa  152  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.81 
 
 		 345 aa  151  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2295  diguanylate cyclase  40.89 
 
 		 503 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3671  putative signaling protein  43.37 
 
 		 480 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  47.4 
 
 		 522 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2063  diguanylate cyclase  46.86 
 
 		 338 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0954  diguanylate cyclase  47.73 
 
 		 502 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0641916  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00826  putative transmembrane protein  42.33 
 
 		 488 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 620 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.63 
 
 		 461 aa  150  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3068  diguanylate cyclase  41.55 
 
 		 516 aa  150  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608977 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  21.08 
 
 		 1112 aa  149  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2914  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.01 
 
 		 312 aa  149  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5857  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.76 
 
 		 341 aa  149  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.6 
 
 		 664 aa  149  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  39.44 
 
 		 591 aa  147  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3172  diguanylate cyclase  42.65 
 
 		 518 aa  148  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0766  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 501 aa  148  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6958  diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 502 aa  147  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>