More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4504 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.97 
 
 		 1836 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  36.02 
 
 		 2279 aa  880    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 1908 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.31 
 
 		 1712 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.7 
 
 		 1833 aa  969    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.2 
 
 		 1797 aa  707    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  38.77 
 
 		 1914 aa  1042    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  43.26 
 
 		 2361 aa  1187    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  45.25 
 
 		 1780 aa  1583    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  48.02 
 
 		 1901 aa  1762    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  53.61 
 
 		 1805 aa  1803    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  51.81 
 
 		 1934 aa  1543    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  55.08 
 
 		 1804 aa  1953    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  51.48 
 
 		 2017 aa  1521    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  55.16 
 
 		 1794 aa  1954    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  50.14 
 
 		 1850 aa  1777    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  60.08 
 
 		 1797 aa  2162    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  100 
 
 		 1795 aa  3684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  43.12 
 
 		 1808 aa  1397    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  33.04 
 
 		 1809 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  45.94 
 
 		 1811 aa  1552    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 		 1644 aa  783    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.25 
 
 		 1885 aa  764    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.84 
 
 		 2303 aa  822    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  32.81 
 
 		 1922 aa  947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.52 
 
 		 2109 aa  768    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.97 
 
 		 1739 aa  674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  41.93 
 
 		 1805 aa  1171    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.01 
 
 		 1774 aa  1072    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.6 
 
 		 1780 aa  969    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.2 
 
 		 1697 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.73 
 
 		 1668 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.65 
 
 		 1871 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.2 
 
 		 1663 aa  742    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  34.82 
 
 		 1837 aa  887    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.29 
 
 		 1822 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  35.82 
 
 		 2272 aa  846    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  41.83 
 
 		 1932 aa  1155    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.14 
 
 		 1942 aa  1541    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.23 
 
 		 2077 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.57 
 
 		 1845 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.59 
 
 		 2051 aa  1257    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  62.86 
 
 		 670 aa  865    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1123 aa  784    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.7 
 
 		 1685 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.52 
 
 		 1832 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.62 
 
 		 1685 aa  559  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.71 
 
 		 1744 aa  553  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.27 
 
 		 1885 aa  532  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.96 
 
 		 1685 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.5 
 
 		 1748 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.03 
 
 		 1788 aa  510  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.27 
 
 		 1756 aa  499  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  24.97 
 
 		 1710 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.58 
 
 		 1682 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.09 
 
 		 1682 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 1637 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  28.86 
 
 		 1112 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  27.87 
 
 		 1064 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.29 
 
 		 1643 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  28.18 
 
 		 1060 aa  383  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 		 1636 aa  384  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 1629 aa  384  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 494 aa  380  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  59.53 
 
 		 342 aa  361  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  54.03 
 
 		 443 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  26.16 
 
 		 1123 aa  317  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  54.48 
 
 		 437 aa  314  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 680 aa  311  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.43 
 
 		 439 aa  303  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 1473 aa  299  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 1473 aa  299  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 431 aa  298  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.99 
 
 		 1473 aa  297  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 		 407 aa  295  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.81 
 
 		 715 aa  293  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 1649 aa  291  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 1072 aa  290  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  49.47 
 
 		 971 aa  289  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 585 aa  288  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 699 aa  287  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.49 
 
 		 594 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 688 aa  284  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 641 aa  283  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  48.95 
 
 		 468 aa  281  9e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 		 440 aa  280  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.42 
 
 		 675 aa  280  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 928 aa  278  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 920 aa  278  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 		 468 aa  276  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  46.75 
 
 		 458 aa  275  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 1036 aa  274  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.57 
 
 		 537 aa  271  7e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  51.12 
 
 		 591 aa  270  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  47.55 
 
 		 468 aa  270  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.31 
 
 		 437 aa  268  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 551 aa  266  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 		 1726 aa  262  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 470 aa  257  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.12 
 
 		 1255 aa  256  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>