More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1234 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
1908 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  45.85 
 
 
1845 aa  1193    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
1942 aa  749    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.32 
 
 
1822 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.96 
 
 
2051 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.73 
 
 
1774 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  32.52 
 
 
2361 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.6 
 
 
1780 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.71 
 
 
1901 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.47 
 
 
1805 aa  740    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  31.61 
 
 
1934 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.43 
 
 
1804 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.94 
 
 
2017 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.42 
 
 
1794 aa  719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.62 
 
 
1850 aa  781    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.44 
 
 
1797 aa  715    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.2 
 
 
1795 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.92 
 
 
1808 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.38 
 
 
1748 aa  653    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  44.84 
 
 
1697 aa  1130    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  40.24 
 
 
1836 aa  999    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  39.37 
 
 
1833 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.47 
 
 
1922 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.06 
 
 
2077 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 
1914 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  46.99 
 
 
1837 aa  1227    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  43.47 
 
 
1712 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  88.84 
 
 
1668 aa  2998    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  30.74 
 
 
2272 aa  672    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.62 
 
 
2279 aa  665    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
1644 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  100 
 
 
1663 aa  3372    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.33 
 
 
1685 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  28.76 
 
 
1811 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 
1805 aa  773    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
1932 aa  783    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  36.14 
 
 
1685 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  43.99 
 
 
1809 aa  1213    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  29.96 
 
 
2303 aa  630  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  31.57 
 
 
1744 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.99 
 
 
1739 aa  596  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  28.83 
 
 
1871 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.81 
 
 
1780 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  29.44 
 
 
1685 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.11 
 
 
1885 aa  562  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.83 
 
 
2109 aa  562  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  27.52 
 
 
1682 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  27.22 
 
 
1682 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.73 
 
 
1797 aa  506  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  28.64 
 
 
1710 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.18 
 
 
1788 aa  463  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.89 
 
 
1885 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.12 
 
 
1756 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
670 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
1637 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.28 
 
 
1832 aa  389  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
1636 aa  390  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 
1643 aa  387  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
1629 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1649 aa  348  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
1123 aa  337  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
1726 aa  322  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.04 
 
 
1064 aa  276  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.85 
 
 
1060 aa  276  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  26.08 
 
 
1473 aa  256  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  26.08 
 
 
1473 aa  254  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  26.08 
 
 
1473 aa  254  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  27.33 
 
 
1112 aa  247  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.79 
 
 
1123 aa  224  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
964 aa  191  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
1654 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  45.33 
 
 
744 aa  189  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 
1714 aa  185  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.37 
 
 
1255 aa  184  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.45 
 
 
1774 aa  185  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
771 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
3706 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  45.67 
 
 
783 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  43 
 
 
488 aa  175  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  21.37 
 
 
900 aa  174  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
572 aa  174  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
941 aa  173  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
839 aa  174  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
991 aa  173  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
1560 aa  174  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
1093 aa  173  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
1093 aa  171  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
815 aa  171  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 
439 aa  169  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
1253 aa  168  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.33 
 
 
918 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
2693 aa  168  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
932 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.7 
 
 
2312 aa  166  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
834 aa  166  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
674 aa  166  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  41.59 
 
 
1210 aa  165  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  41.67 
 
 
1239 aa  164  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
681 aa  164  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
1183 aa  164  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>