154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48535 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  100 
 
 
1112 aa  2304    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  39.5 
 
 
1255 aa  767    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  40.67 
 
 
1123 aa  804    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.74 
 
 
1901 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.05 
 
 
1797 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.86 
 
 
1795 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.77 
 
 
1808 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  27.98 
 
 
1850 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.24 
 
 
2051 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.31 
 
 
1780 aa  403  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  29.36 
 
 
1934 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
1942 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.91 
 
 
1804 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 
1908 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  29.25 
 
 
2361 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.37 
 
 
1794 aa  373  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 
2077 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
1932 aa  364  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 
1805 aa  359  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.77 
 
 
1805 aa  357  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  27.17 
 
 
1064 aa  352  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  26.65 
 
 
1922 aa  345  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.31 
 
 
2017 aa  344  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  26.42 
 
 
1809 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  25.27 
 
 
1811 aa  333  8e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.05 
 
 
1780 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.19 
 
 
2109 aa  320  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.39 
 
 
1774 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.55 
 
 
1833 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.12 
 
 
1871 aa  313  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 
1914 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.95 
 
 
1060 aa  302  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  25.82 
 
 
1697 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  24.88 
 
 
2279 aa  294  5e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.19 
 
 
1845 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  25.81 
 
 
1712 aa  281  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.98 
 
 
1837 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  25.82 
 
 
1668 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.16 
 
 
2272 aa  273  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.85 
 
 
1822 aa  268  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  25.14 
 
 
2303 aa  265  4e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  25.7 
 
 
1885 aa  264  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
1644 aa  262  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  24.34 
 
 
1739 aa  259  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  26.44 
 
 
1836 aa  248  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.33 
 
 
1663 aa  247  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.79 
 
 
1797 aa  235  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  25.79 
 
 
900 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
670 aa  201  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  22.73 
 
 
1685 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.47 
 
 
1885 aa  191  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 
1473 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  22.88 
 
 
1682 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  23.06 
 
 
1682 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 
1473 aa  180  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 
1473 aa  180  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  22.79 
 
 
1086 aa  178  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  23.84 
 
 
1710 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  22.61 
 
 
1788 aa  169  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  23.42 
 
 
1015 aa  169  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  20.41 
 
 
1685 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  22.41 
 
 
1744 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  20.06 
 
 
1685 aa  161  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
1123 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.18 
 
 
1832 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  21.64 
 
 
1636 aa  141  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  22.29 
 
 
1637 aa  138  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  21.91 
 
 
1756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  20.81 
 
 
1629 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
1643 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
1726 aa  118  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  21.83 
 
 
1649 aa  118  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.44 
 
 
1748 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  21.45 
 
 
859 aa  90.9  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  20.18 
 
 
2312 aa  82.8  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  22.95 
 
 
1029 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  23.66 
 
 
966 aa  77.4  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  20.91 
 
 
1022 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  22.97 
 
 
981 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  20.38 
 
 
954 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
1446 aa  68.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 
862 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.49 
 
 
1054 aa  62.4  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  21.22 
 
 
900 aa  61.6  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  23.66 
 
 
1118 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.11 
 
 
1071 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.02 
 
 
852 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  21.27 
 
 
1084 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.91 
 
 
1089 aa  59.7  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 
1235 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  26.36 
 
 
1029 aa  58.9  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  21.04 
 
 
1015 aa  58.9  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  22.79 
 
 
1150 aa  58.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  20.78 
 
 
992 aa  58.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  20.79 
 
 
1132 aa  57.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  20.73 
 
 
1006 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  20.53 
 
 
1190 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  26.2 
 
 
1051 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.22 
 
 
1403 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  21.48 
 
 
916 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>