More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0854 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.45 
 
 		 2077 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.43 
 
 		 1712 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.65 
 
 		 1774 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.16 
 
 		 1845 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.39 
 
 		 1809 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  33.75 
 
 		 2361 aa  780    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.33 
 
 		 1780 aa  785    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.55 
 
 		 1901 aa  839    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.96 
 
 		 1805 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  33.88 
 
 		 1934 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.51 
 
 		 1804 aa  757    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.25 
 
 		 2017 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.61 
 
 		 1794 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.98 
 
 		 1850 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.03 
 
 		 1797 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.65 
 
 		 1795 aa  774    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.48 
 
 		 1808 aa  799    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  32.03 
 
 		 1922 aa  875    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 1914 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 		 1908 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  31.59 
 
 		 1697 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1942 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.66 
 
 		 1833 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.82 
 
 		 1780 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.34 
 
 		 2051 aa  989    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 1871 aa  3849    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  29.08 
 
 		 1811 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  31.63 
 
 		 1805 aa  751    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 1932 aa  744    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  32.21 
 
 		 1885 aa  793    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  31.62 
 
 		 1837 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  31.04 
 
 		 2279 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.6 
 
 		 1668 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.92 
 
 		 1663 aa  593  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.75 
 
 		 1822 aa  589  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  29.98 
 
 		 2272 aa  588  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.08 
 
 		 2303 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  30.3 
 
 		 1836 aa  569  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.96 
 
 		 2109 aa  546  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.33 
 
 		 1797 aa  534  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.93 
 
 		 1739 aa  513  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 1644 aa  498  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.66 
 
 		 1685 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.49 
 
 		 1685 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.23 
 
 		 1744 aa  430  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.92 
 
 		 1788 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  27.45 
 
 		 1710 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1685 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.57 
 
 		 1885 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.93 
 
 		 1748 aa  396  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.11 
 
 		 1832 aa  374  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  26.45 
 
 		 1756 aa  365  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 1123 aa  362  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  24.54 
 
 		 1682 aa  356  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.41 
 
 		 1682 aa  348  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  23.48 
 
 		 2312 aa  333  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 1629 aa  327  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.19 
 
 		 1112 aa  320  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 		 1637 aa  320  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.34 
 
 		 1064 aa  309  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 		 1636 aa  308  8.000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 		 1643 aa  305  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1127 aa  298  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 873 aa  295  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 947 aa  292  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 962 aa  290  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 718 aa  288  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.23 
 
 		 1060 aa  288  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 1229 aa  286  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 877 aa  286  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 724 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.44 
 
 		 968 aa  285  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  38.52 
 
 		 528 aa  285  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.64 
 
 		 982 aa  285  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 1204 aa  284  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 876 aa  283  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.3 
 
 		 735 aa  283  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 863 aa  282  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 882 aa  281  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 717 aa  278  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 932 aa  278  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.3 
 
 		 631 aa  278  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1313 aa  278  9e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  39.31 
 
 		 1028 aa  277  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 785 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1287 aa  276  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 653 aa  275  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1027 aa  275  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 944 aa  274  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 850 aa  274  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 781 aa  274  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.64 
 
 		 661 aa  274  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.15 
 
 		 666 aa  273  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 1452 aa  273  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.01 
 
 		 651 aa  272  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.32 
 
 		 588 aa  272  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 785 aa  272  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 895 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 772 aa  271  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>