More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3522 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1287 aa  2645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  33.89 
 
 
1028 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
1313 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.4 
 
 
1560 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1407 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 
791 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1195 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
902 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
926 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1029 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
1127 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1064 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.11 
 
 
982 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
1229 aa  390  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1015 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1053 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.22 
 
 
763 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
1788 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1033 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
932 aa  370  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1202 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1275 aa  365  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1118 aa  360  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
1452 aa  360  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
939 aa  358  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
927 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
785 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1767 aa  353  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1771 aa  353  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1767 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1767 aa  353  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
944 aa  349  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.42 
 
 
1135 aa  348  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.58 
 
 
1765 aa  348  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1064 aa  346  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
940 aa  340  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.54 
 
 
1120 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
767 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
959 aa  337  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1023 aa  336  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  48.87 
 
 
735 aa  336  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
816 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
1059 aa  335  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.92 
 
 
1038 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
882 aa  332  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
1193 aa  332  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1267 aa  331  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.81 
 
 
1060 aa  331  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
781 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  43.9 
 
 
666 aa  331  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
827 aa  330  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
1768 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
1177 aa  330  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
957 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  32.15 
 
 
1141 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1007 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1066 aa  327  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.35 
 
 
620 aa  326  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
846 aa  326  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1044 aa  327  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
647 aa  327  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
881 aa  326  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
896 aa  325  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
947 aa  325  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1765 aa  324  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.8 
 
 
823 aa  324  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
647 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1199 aa  322  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
1101 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.57 
 
 
772 aa  322  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  34.37 
 
 
797 aa  322  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
951 aa  322  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.15 
 
 
1763 aa  321  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1782 aa  321  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.27 
 
 
1683 aa  320  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1110 aa  320  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1784 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  37.48 
 
 
810 aa  320  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
724 aa  320  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
1075 aa  320  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 
1236 aa  319  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
860 aa  320  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
765 aa  320  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.64 
 
 
882 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
874 aa  320  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  36.82 
 
 
736 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
1786 aa  319  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.36 
 
 
606 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1230 aa  318  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
916 aa  318  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 
606 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1122 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1260 aa  318  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
1128 aa  318  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1238 aa  317  9e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.28 
 
 
1023 aa  317  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
774 aa  317  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1238 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
778 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1792 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>