More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0599 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
957 aa  1965    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 
995 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 
940 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.86 
 
 
881 aa  512  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.46 
 
 
1007 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.48 
 
 
853 aa  466  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.02 
 
 
704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
738 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1245 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1452 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.11 
 
 
898 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
767 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
865 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.04 
 
 
827 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.13 
 
 
667 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  45.01 
 
 
1193 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
947 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 
743 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.03 
 
 
647 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.78 
 
 
647 aa  393  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  49.38 
 
 
882 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
893 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.49 
 
 
645 aa  383  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
896 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
778 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  48.57 
 
 
399 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.74 
 
 
774 aa  365  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.41 
 
 
763 aa  357  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.15 
 
 
982 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1433 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
902 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1313 aa  350  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.31 
 
 
666 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
627 aa  349  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
1287 aa  347  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
1055 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1127 aa  343  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1078 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
882 aa  340  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  35.91 
 
 
1026 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
1044 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.02 
 
 
772 aa  337  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1177 aa  337  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
862 aa  336  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
1222 aa  334  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
676 aa  333  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
902 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1358 aa  332  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
916 aa  331  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.45 
 
 
1135 aa  331  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
1236 aa  330  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
766 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 
785 aa  330  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.66 
 
 
1560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1229 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1059 aa  329  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
873 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
1791 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1064 aa  327  8.000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
919 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1236 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1236 aa  326  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1236 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  32.92 
 
 
1188 aa  324  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1049 aa  324  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.28 
 
 
823 aa  324  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 
717 aa  324  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1234 aa  323  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
810 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1238 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1238 aa  321  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
955 aa  321  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
939 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1238 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
1109 aa  320  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
1202 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
765 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  42.86 
 
 
606 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
1230 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1238 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
801 aa  318  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 
1132 aa  317  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1029 aa  317  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1234 aa  317  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 
1236 aa  317  9e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1369 aa  316  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
631 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1245 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
1075 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1101 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
982 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  32.9 
 
 
1200 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
674 aa  314  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  44.62 
 
 
571 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1271 aa  313  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
916 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1226 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
1195 aa  313  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.82 
 
 
853 aa  312  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
969 aa  312  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>