More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2468 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1049 aa  2154    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  37.3 
 
 
882 aa  428  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
1433 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.94 
 
 
566 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
1029 aa  361  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
881 aa  343  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  34.97 
 
 
853 aa  334  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  33.48 
 
 
1206 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1191 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1196 aa  319  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  39.67 
 
 
741 aa  318  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
896 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
674 aa  315  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  38.76 
 
 
1215 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
1407 aa  310  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
957 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1069 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  37.81 
 
 
1212 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.97 
 
 
968 aa  303  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  40.04 
 
 
691 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  43.18 
 
 
1040 aa  302  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
865 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.48 
 
 
763 aa  300  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.96 
 
 
1023 aa  300  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.15 
 
 
1026 aa  299  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
738 aa  297  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
639 aa  297  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
717 aa  295  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
959 aa  294  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.57 
 
 
982 aa  294  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
631 aa  293  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
817 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
781 aa  293  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
1127 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1091 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
1199 aa  291  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.32 
 
 
1028 aa  290  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1093 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.25 
 
 
823 aa  290  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  32.02 
 
 
1211 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.96 
 
 
1560 aa  289  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1210 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1075 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
866 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
767 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
902 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
947 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1214 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
1090 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
874 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  38.7 
 
 
641 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1001 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
1093 aa  285  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  30.86 
 
 
1209 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  31.35 
 
 
1213 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  35.61 
 
 
477 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.68 
 
 
1763 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
778 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
846 aa  280  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
631 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1068 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
1452 aa  277  8e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1201 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
882 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
764 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
932 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.79 
 
 
772 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
724 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1064 aa  274  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1350 aa  273  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1374 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1055 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
863 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1326 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.71 
 
 
582 aa  271  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.54 
 
 
588 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
1068 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.65 
 
 
606 aa  270  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
846 aa  270  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
862 aa  270  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
643 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
995 aa  269  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1350 aa  269  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1433 aa  269  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1222 aa  269  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  29.49 
 
 
1193 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
762 aa  268  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1059 aa  268  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1204 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 
643 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  29.16 
 
 
1119 aa  268  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  39.81 
 
 
1286 aa  267  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
846 aa  267  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
807 aa  267  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
718 aa  267  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  36.75 
 
 
641 aa  267  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
667 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
645 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.62 
 
 
651 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>