More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5710 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  100 
 
 
1040 aa  2114    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  31.72 
 
 
1206 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
1214 aa  512  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  33.65 
 
 
1211 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1210 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
1201 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  32.27 
 
 
1215 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  33.46 
 
 
1209 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1196 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  31.25 
 
 
1213 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  30.92 
 
 
1212 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  32.06 
 
 
1286 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1191 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  47.82 
 
 
679 aa  436  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  32.19 
 
 
1199 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.23 
 
 
1197 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1197 aa  392  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.2 
 
 
1197 aa  392  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.23 
 
 
1197 aa  392  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  29.23 
 
 
1197 aa  392  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.1 
 
 
1197 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.97 
 
 
1197 aa  389  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.18 
 
 
1127 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  41.08 
 
 
691 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  40.65 
 
 
741 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.74 
 
 
1127 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1165 aa  343  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 
796 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
1199 aa  306  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1788 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.24 
 
 
772 aa  302  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
1049 aa  302  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 
1410 aa  294  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  28.8 
 
 
751 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
803 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
916 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.53 
 
 
1331 aa  270  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
1069 aa  268  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.01 
 
 
1535 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1044 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
843 aa  265  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1127 aa  265  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1622 aa  264  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
705 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
1350 aa  263  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
1002 aa  262  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
1358 aa  262  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
1093 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 
1093 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
767 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
1596 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1287 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.39 
 
 
1763 aa  259  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1433 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.32 
 
 
1135 aa  258  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
1001 aa  258  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1611 aa  258  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1363 aa  257  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
822 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
913 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
896 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  37.23 
 
 
697 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
903 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1340 aa  255  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
524 aa  255  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
765 aa  255  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  39.21 
 
 
882 aa  255  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
874 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  36.05 
 
 
1193 aa  254  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1039 aa  254  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
678 aa  254  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
982 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
939 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
932 aa  253  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  38.16 
 
 
982 aa  253  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
862 aa  253  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1195 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
674 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
647 aa  252  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1002 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
554 aa  251  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  40.58 
 
 
742 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1169 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
846 aa  251  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
969 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
948 aa  251  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1313 aa  251  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
606 aa  251  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1091 aa  251  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1090 aa  250  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
778 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1116 aa  250  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
785 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.36 
 
 
631 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1078 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.06 
 
 
763 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1096 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1064 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1075 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
1055 aa  248  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>