More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2015 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.74 
 
 		 1168 aa  1130    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 1119 aa  2293    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1434  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 		 1186 aa  1088    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2941  putative PAS/PAC sensor protein  52.01 
 
 		 1169 aa  1170    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.725686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30 
 
 		 2213 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1069 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1369 aa  341  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  36.31 
 
 		 823 aa  337  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1202 aa  332  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1550 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  28.65 
 
 		 1683 aa  328  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1266 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.1 
 
 		 1468 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 1363 aa  322  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1303 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 916 aa  321  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1397 aa  321  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1326 aa  320  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1433 aa  318  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 		 1258 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1548 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1767 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 921 aa  312  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1118 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.31 
 
 		 1442 aa  311  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1767 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1255 aa  310  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1767 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 1374 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 801 aa  305  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 		 1340 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.93 
 
 		 1765 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1165 aa  303  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  33.29 
 
 		 1030 aa  299  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1622 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.69 
 
 		 1014 aa  296  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1611 aa  295  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.32 
 
 		 852 aa  294  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1310 aa  294  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.69 
 
 		 2035 aa  294  6e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 946 aa  294  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1033 aa  293  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.59 
 
 		 923 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1771 aa  292  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 833 aa  292  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.18 
 
 		 1001 aa  291  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 1480 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.52 
 
 		 1331 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 816 aa  288  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1005 aa  288  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  27.78 
 
 		 1135 aa  287  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1236 aa  287  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.35 
 
 		 1499 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1820 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1384 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 929 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 1064 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 1560 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 936 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  28.94 
 
 		 1418 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 830 aa  285  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1691 aa  284  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1267 aa  284  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  31.88 
 
 		 1177 aa  283  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.52 
 
 		 1346 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1203 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1768 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  32.64 
 
 		 750 aa  283  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1128 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 812 aa  282  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1193 aa  281  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.75 
 
 		 1407 aa  281  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 957 aa  281  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1309 aa  280  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.28 
 
 		 925 aa  280  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1788 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 745 aa  279  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 1054 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.91 
 
 		 1200 aa  279  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 1659 aa  280  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1245 aa  278  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 1574 aa  278  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  37.38 
 
 		 914 aa  278  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  36.59 
 
 		 925 aa  278  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 1625 aa  278  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 1692 aa  277  8e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1055 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 752 aa  277  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1305 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  31.78 
 
 		 727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.53 
 
 		 1763 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.83 
 
 		 1653 aa  276  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  30.05 
 
 		 1287 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 		 1686 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 1230 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  30.87 
 
 		 1179 aa  275  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1397 aa  274  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.97 
 
 		 1214 aa  274  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1398 aa  274  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1009 aa  274  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>