More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3366 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 762 aa  1551    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  52.47 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  47.42 
 
 		 1023 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  47.51 
 
 		 955 aa  436  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 945 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 865 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.22 
 
 		 982 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.71 
 
 		 1407 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  50.58 
 
 		 1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.66 
 
 		 759 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.93 
 
 		 873 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  52.64 
 
 		 655 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.87 
 
 		 860 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  53.87 
 
 		 853 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.61 
 
 		 1066 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  47.19 
 
 		 787 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  49.2 
 
 		 1560 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.6 
 
 		 1064 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.34 
 
 		 1110 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.58 
 
 		 1135 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.96 
 
 		 777 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  50 
 
 		 764 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  47.12 
 
 		 659 aa  360  4e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  47.77 
 
 		 596 aa  360  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  40.86 
 
 		 1026 aa  351  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.16 
 
 		 846 aa  347  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 951 aa  336  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  38.53 
 
 		 901 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 		 817 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1078 aa  328  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.58 
 
 		 846 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  47.63 
 
 		 735 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 1199 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 		 781 aa  316  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 789 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 957 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 973 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 		 717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1127 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  40.04 
 
 		 802 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  40.51 
 
 		 1060 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.17 
 
 		 932 aa  301  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 1284 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  42.89 
 
 		 968 aa  300  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.3 
 
 		 982 aa  300  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1023 aa  297  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  43.14 
 
 		 826 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  37.28 
 
 		 803 aa  296  7e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1059 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  41.09 
 
 		 544 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.25 
 
 		 1275 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1350 aa  293  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 1195 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.7 
 
 		 578 aa  293  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 1302 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.5 
 
 		 620 aa  291  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.17 
 
 		 582 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 631 aa  290  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 		 944 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  42.92 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 969 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 685 aa  287  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.43 
 
 		 661 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  40.42 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.21 
 
 		 962 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 1310 aa  286  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1350 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 		 1433 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 		 995 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 846 aa  284  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 		 1596 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 882 aa  284  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 785 aa  283  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 		 947 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.43 
 
 		 738 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 1029 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1124 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 781 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  35.28 
 
 		 823 aa  282  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  41.43 
 
 		 762 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  41.97 
 
 		 786 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 876 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 873 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1204 aa  280  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 		 1959 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.59 
 
 		 631 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 743 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1313 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 790 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1765 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.67 
 
 		 858 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1927 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.36 
 
 		 751 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 881 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.54 
 
 		 835 aa  277  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>