More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0522 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  100 
 
 		 751 aa  1526    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 695 aa  342  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 737 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 1199 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 864 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 		 866 aa  312  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 		 982 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.79 
 
 		 968 aa  303  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.27 
 
 		 1560 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1195 aa  300  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 863 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 969 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 1135 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1433 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 865 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 764 aa  293  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.35 
 
 		 973 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 945 aa  293  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  36.45 
 
 		 784 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  36.61 
 
 		 955 aa  291  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 781 aa  291  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.23 
 
 		 661 aa  290  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 850 aa  290  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 822 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.89 
 
 		 1028 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 879 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 		 882 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1287 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 1691 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 880 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 631 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 817 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.39 
 
 		 655 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 765 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 827 aa  282  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 738 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 873 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1127 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.94 
 
 		 631 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 		 1066 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1226 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 		 762 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1452 aa  280  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 1407 aa  279  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 876 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 		 874 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 643 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 932 aa  277  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 860 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 781 aa  277  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 969 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.65 
 
 		 651 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 		 902 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 724 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 759 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  40.05 
 
 		 729 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 		 846 aa  274  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 		 1350 aa  274  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  41.75 
 
 		 853 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 643 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.82 
 
 		 544 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 982 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  39.76 
 
 		 735 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1068 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.55 
 
 		 777 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.34 
 
 		 659 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 		 923 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  40.74 
 
 		 1125 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 785 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  41.62 
 
 		 794 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1059 aa  271  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  39.16 
 
 		 803 aa  271  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  35.83 
 
 		 793 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1202 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 965 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.45 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.13 
 
 		 553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 1070 aa  270  5.9999999999999995e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1596 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1110 aa  270  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 846 aa  270  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.75 
 
 		 651 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.48 
 
 		 835 aa  270  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 		 1075 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 782 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 1125 aa  269  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 718 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  40.85 
 
 		 1023 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 846 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.82 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 687 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 524 aa  267  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  39.66 
 
 		 641 aa  267  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 789 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 877 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 690 aa  266  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>