More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3026 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  82.06 
 
 
973 aa  1548    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
969 aa  1952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
1350 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 
1596 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1009 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 
1362 aa  362  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 
984 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 
882 aa  358  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1015 aa  351  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1121 aa  348  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
982 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.75 
 
 
524 aa  344  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1195 aa  344  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.93 
 
 
982 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  44.51 
 
 
900 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  45.18 
 
 
661 aa  334  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
957 aa  333  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
765 aa  333  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
896 aa  330  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
863 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
1044 aa  328  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.79 
 
 
873 aa  327  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
1313 aa  327  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
881 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
1226 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
940 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
738 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
1363 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
1691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 
604 aa  322  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
862 aa  322  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1202 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 
785 aa  321  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 
1078 aa  320  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
995 aa  319  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.68 
 
 
1023 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
866 aa  317  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 
717 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
1499 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
1023 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 
1157 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
1177 aa  314  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
1069 aa  313  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1223 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
902 aa  313  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
803 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
1433 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
781 aa  311  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
791 aa  311  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
710 aa  311  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
817 aa  311  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  42.42 
 
 
968 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  41 
 
 
589 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.1 
 
 
666 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
969 aa  308  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1267 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1007 aa  307  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.51 
 
 
544 aa  307  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
865 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
902 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
944 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
780 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1127 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.11 
 
 
627 aa  306  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  46.1 
 
 
571 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  45.43 
 
 
578 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1204 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  41.28 
 
 
732 aa  303  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1116 aa  304  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  44.5 
 
 
559 aa  304  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
704 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
959 aa  302  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
1075 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.46 
 
 
582 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
903 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.43 
 
 
1199 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 
650 aa  301  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.37 
 
 
606 aa  300  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
939 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1222 aa  300  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.69 
 
 
736 aa  300  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.16 
 
 
1560 aa  300  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 
592 aa  300  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  41.41 
 
 
786 aa  300  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  32.78 
 
 
1141 aa  299  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
827 aa  299  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  44.33 
 
 
553 aa  299  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
868 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1369 aa  298  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
957 aa  298  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
764 aa  298  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
962 aa  298  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
910 aa  297  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.68 
 
 
751 aa  297  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 
832 aa  297  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
827 aa  297  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.89 
 
 
1005 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  46.92 
 
 
737 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
1229 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>