More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3466 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 1157 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.69 
 
 		 1124 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1362 aa  2684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 1125 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  48.9 
 
 		 1125 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 		 1120 aa  559  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 		 910 aa  532  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 1009 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 984 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  55.11 
 
 		 900 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.83 
 
 		 1350 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.12 
 
 		 873 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.73 
 
 		 1596 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  48.2 
 
 		 737 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 		 969 aa  370  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 		 973 aa  362  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 		 1158 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 903 aa  361  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 		 524 aa  352  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1433 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.55 
 
 		 589 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 865 aa  337  9e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 765 aa  336  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.48 
 
 		 817 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 873 aa  321  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 717 aa  317  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1313 aa  317  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 896 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.85 
 
 		 968 aa  315  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.62 
 
 		 990 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1177 aa  315  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 969 aa  314  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 803 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 		 982 aa  313  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 		 895 aa  312  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 764 aa  312  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 877 aa  312  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1611 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.06 
 
 		 687 aa  311  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  30.71 
 
 		 856 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.24 
 
 		 1023 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 		 772 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.71 
 
 		 785 aa  308  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 		 1199 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1578 aa  308  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.44 
 
 		 544 aa  307  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.02 
 
 		 1452 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1044 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1070 aa  307  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1131 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 932 aa  305  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  31.7 
 
 		 1560 aa  304  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 1059 aa  304  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.42 
 
 		 1135 aa  303  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 982 aa  302  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 		 882 aa  301  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.55 
 
 		 666 aa  300  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1222 aa  300  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  46.89 
 
 		 538 aa  299  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 876 aa  299  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 1369 aa  300  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 863 aa  299  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1121 aa  299  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1050 aa  298  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 		 864 aa  298  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 		 863 aa  297  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1202 aa  296  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 1110 aa  295  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 1075 aa  295  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 951 aa  294  9e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  34.82 
 
 		 1626 aa  294  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.56 
 
 		 661 aa  293  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1027 aa  293  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 939 aa  292  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 902 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 650 aa  291  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 957 aa  290  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1659 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 860 aa  290  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  33.71 
 
 		 853 aa  290  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 801 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 850 aa  289  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1070 aa  289  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 		 1691 aa  289  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  40.62 
 
 		 697 aa  288  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1204 aa  288  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  42.12 
 
 		 676 aa  287  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  40.22 
 
 		 794 aa  287  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 		 1195 aa  287  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1127 aa  287  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 873 aa  287  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 940 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  45.48 
 
 		 735 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 667 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1407 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 880 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 782 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  39.56 
 
 		 826 aa  285  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 1116 aa  285  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 		 846 aa  285  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>