More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2061 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
738 aa  1508    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
647 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
767 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.38 
 
 
647 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
940 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
957 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
774 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 
995 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.05 
 
 
667 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
881 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
1007 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 
898 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
704 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.2 
 
 
882 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
947 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.51 
 
 
645 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  47.92 
 
 
399 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  41.29 
 
 
1193 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 
902 aa  364  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
893 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
743 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.93 
 
 
982 aa  361  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1363 aa  361  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
1229 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.2 
 
 
827 aa  356  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
1075 aa  349  9e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
862 aa  349  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1199 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
969 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1127 aa  341  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
627 aa  340  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
896 aa  336  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
1313 aa  334  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  40.81 
 
 
2109 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.28 
 
 
763 aa  334  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1055 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.65 
 
 
772 aa  330  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.08 
 
 
1560 aa  329  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
973 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
1350 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
902 aa  327  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
1177 aa  326  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
718 aa  326  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
674 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
1059 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1222 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1121 aa  324  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1369 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.48 
 
 
1120 aa  323  8e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
969 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
785 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
1433 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
765 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
882 aa  317  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
870 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 
724 aa  317  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.44 
 
 
661 aa  317  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
1044 aa  316  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
1109 aa  316  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
957 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1023 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
788 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1452 aa  315  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
1287 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
1116 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 
717 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.63 
 
 
641 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.84 
 
 
1023 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 
791 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
780 aa  313  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  38.42 
 
 
589 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.8 
 
 
606 aa  313  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
952 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
766 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
944 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1078 aa  309  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
932 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
1101 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1195 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
1226 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  43.8 
 
 
544 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
939 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1132 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1771 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.8 
 
 
1535 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1079 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
1767 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
1767 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
810 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.26 
 
 
853 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.88 
 
 
559 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.2 
 
 
1135 aa  305  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
1267 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
965 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
816 aa  304  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  41.06 
 
 
571 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
863 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1767 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
916 aa  303  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 
803 aa  303  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>