More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3203 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
765 aa  1543    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
1433 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.61 
 
 
982 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.23 
 
 
817 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
881 aa  350  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  48.01 
 
 
666 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
1369 aa  349  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 
973 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.42 
 
 
1120 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.49 
 
 
902 aa  346  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  48.73 
 
 
781 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
1350 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
801 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
1059 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
916 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  43.63 
 
 
968 aa  340  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 
785 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
631 aa  337  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1127 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 
969 aa  337  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  48.47 
 
 
793 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
1452 aa  335  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.7 
 
 
763 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 
969 aa  333  7.000000000000001e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
863 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  48.48 
 
 
764 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
1350 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
816 aa  331  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  43.44 
 
 
544 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1121 aa  330  6e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
1007 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 
606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 
940 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
932 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
647 aa  328  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
939 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  41.2 
 
 
641 aa  328  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
873 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
882 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
1362 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.44 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
898 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.55 
 
 
659 aa  327  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.37 
 
 
1791 aa  326  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1287 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
827 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
1075 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
717 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.06 
 
 
620 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
865 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  47.44 
 
 
661 aa  324  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
772 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  47.61 
 
 
729 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
876 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
767 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
1596 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  45.5 
 
 
882 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
791 aa  323  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
773 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
1044 aa  321  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
785 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  47.24 
 
 
606 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.74 
 
 
846 aa  320  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
877 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1765 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.72 
 
 
641 aa  320  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
860 aa  320  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
827 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1122 aa  319  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  45.69 
 
 
786 aa  319  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.64 
 
 
738 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1199 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 
850 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  45.22 
 
 
588 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  46.01 
 
 
578 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
1767 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
951 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  37.78 
 
 
856 aa  318  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1132 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
1135 aa  318  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1120 aa  318  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
869 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
1267 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
1229 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  42.27 
 
 
1125 aa  317  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1768 aa  317  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1767 aa  317  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
1064 aa  317  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1202 aa  316  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  45.27 
 
 
1028 aa  316  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.49 
 
 
1023 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1313 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1767 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  38.31 
 
 
1111 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
690 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
762 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>