More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4279 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
951 aa  1871    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  52.18 
 
 
826 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 
762 aa  336  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  43.62 
 
 
1560 aa  328  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1287 aa  321  5e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
873 aa  320  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 
850 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  46.68 
 
 
735 aa  318  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.34 
 
 
1066 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
880 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.26 
 
 
860 aa  313  7.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
879 aa  313  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
765 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 
1229 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.75 
 
 
1023 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  45.43 
 
 
1028 aa  307  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.14 
 
 
1199 aa  307  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
1110 aa  306  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.99 
 
 
1023 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
1135 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  42.96 
 
 
794 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  46.49 
 
 
655 aa  304  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.07 
 
 
945 aa  304  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
764 aa  304  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  44.44 
 
 
853 aa  303  8.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.88 
 
 
1407 aa  303  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1433 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.88 
 
 
777 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
903 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.7 
 
 
968 aa  300  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
781 aa  299  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1195 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  38.76 
 
 
982 aa  298  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
873 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
789 aa  297  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
944 aa  297  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  45.57 
 
 
596 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  44.89 
 
 
787 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
1064 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
982 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 
759 aa  294  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.51 
 
 
763 aa  294  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.43 
 
 
1596 aa  294  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
1768 aa  293  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  41.5 
 
 
544 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
606 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 
1362 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1350 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  44.47 
 
 
955 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 
1158 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
896 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
932 aa  290  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1059 aa  290  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
874 aa  290  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1452 aa  290  9e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  43.37 
 
 
666 aa  290  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  41.33 
 
 
1060 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
984 aa  290  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
1009 aa  289  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1078 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  42.92 
 
 
900 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
1765 aa  287  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
863 aa  287  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
865 aa  287  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1326 aa  287  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  41.09 
 
 
764 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
947 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
1124 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 
846 aa  284  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.81 
 
 
1165 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
864 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
876 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  43.19 
 
 
758 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1226 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  38.83 
 
 
691 aa  280  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  33.68 
 
 
732 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.69 
 
 
659 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 
866 aa  280  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
873 aa  280  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
643 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
902 aa  279  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  40.84 
 
 
1125 aa  279  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1157 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  30.67 
 
 
856 aa  278  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
724 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
877 aa  278  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1222 aa  277  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
846 aa  277  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
773 aa  277  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
969 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  38.9 
 
 
797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1075 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  43.09 
 
 
1763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
1127 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.41 
 
 
631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 
1548 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
1611 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
1767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
1767 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
1767 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>