More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3786 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 606 aa  1221    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 		 643 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  49.12 
 
 		 781 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.98 
 
 		 643 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  47.31 
 
 		 982 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 		 643 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 765 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.37 
 
 		 633 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.99 
 
 		 631 aa  329  9e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  43.7 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  43.96 
 
 		 651 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 		 643 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1287 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 		 1433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.52 
 
 		 876 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 		 898 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 785 aa  319  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  44.44 
 
 		 968 aa  319  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  45.55 
 
 		 606 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.27 
 
 		 645 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  46.11 
 
 		 735 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  42.64 
 
 		 641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 		 877 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 		 873 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 		 1127 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  44.82 
 
 		 1028 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 896 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  46.4 
 
 		 571 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.95 
 
 		 846 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.58 
 
 		 1199 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  43.75 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 982 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 		 816 aa  306  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  45.59 
 
 		 793 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.95 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 738 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 947 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 1350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  46.07 
 
 		 559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 		 772 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.82 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.7 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 		 817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1195 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 		 902 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 932 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 		 880 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 		 995 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 667 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 1066 aa  303  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 945 aa  302  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 827 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 881 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  44.24 
 
 		 666 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 940 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  43.63 
 
 		 589 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  44.13 
 
 		 729 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  43.42 
 
 		 1023 aa  300  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  43.3 
 
 		 882 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  41.75 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.78 
 
 		 659 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.33 
 
 		 661 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 644 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 		 944 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  42.33 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.36 
 
 		 738 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.58 
 
 		 582 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 916 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 		 1075 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 		 951 aa  297  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 		 827 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.81 
 
 		 772 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 		 1135 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  43.14 
 
 		 751 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 1059 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 860 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.68 
 
 		 879 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 		 874 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  43.85 
 
 		 1885 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  42.16 
 
 		 1560 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.81 
 
 		 781 aa  292  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 1202 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 865 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 882 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 959 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.97 
 
 		 973 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  42.57 
 
 		 823 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.63 
 
 		 850 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 969 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.15 
 
 		 853 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.47 
 
 		 947 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 1128 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  42.53 
 
 		 784 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 864 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  41.85 
 
 		 671 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 1313 aa  290  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.65 
 
 		 873 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>