More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4211 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  72.25 
 
 		 643 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  65.88 
 
 		 641 aa  818    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  68.89 
 
 		 651 aa  843    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  67.87 
 
 		 645 aa  845    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  67.03 
 
 		 631 aa  767    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 633 aa  1288    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  72.57 
 
 		 643 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  74.53 
 
 		 643 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  72.09 
 
 		 643 aa  866    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  68.79 
 
 		 651 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 644 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.43 
 
 		 781 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.42 
 
 		 620 aa  339  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 667 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 817 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.44 
 
 		 968 aa  323  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.37 
 
 		 606 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 743 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  45.21 
 
 		 786 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.15 
 
 		 659 aa  320  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.51 
 
 		 631 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 		 785 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 572 aa  316  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.18 
 
 		 846 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.77 
 
 		 772 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 932 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  36.5 
 
 		 793 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.39 
 
 		 982 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 959 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 827 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  44.36 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.47 
 
 		 916 aa  303  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  44.88 
 
 		 578 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 982 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  39.77 
 
 		 1560 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 896 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  35.61 
 
 		 755 aa  300  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 939 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  43.08 
 
 		 1023 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.76 
 
 		 641 aa  298  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 846 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 		 1110 aa  297  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  41.08 
 
 		 1060 aa  297  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 717 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 863 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 1452 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 		 957 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 631 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 759 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.05 
 
 		 735 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 765 aa  294  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.5 
 
 		 1028 aa  293  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 		 873 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.63 
 
 		 764 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.3 
 
 		 1199 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 785 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  40.53 
 
 		 589 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 		 902 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 1433 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1135 aa  290  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 893 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 940 aa  289  8e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 865 aa  289  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.62 
 
 		 606 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.06 
 
 		 853 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 881 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.68 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.95 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 1075 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  42.78 
 
 		 729 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  44.77 
 
 		 571 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 860 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 827 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  38.43 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1195 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 882 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 923 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1287 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  40.91 
 
 		 666 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 822 aa  283  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 627 aa  283  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 973 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 902 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 874 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 1055 aa  282  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.3 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 995 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 1229 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 977 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.55 
 
 		 763 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  35.95 
 
 		 732 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 		 1358 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.84 
 
 		 1109 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1127 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  43.16 
 
 		 559 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 1059 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 816 aa  278  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 623 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 1204 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>