More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3445 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
717 aa  1451    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
724 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
718 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  57.28 
 
 
850 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
817 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.47 
 
 
982 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.79 
 
 
968 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
781 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
764 aa  356  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
1127 aa  349  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.76 
 
 
1560 aa  349  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.22 
 
 
881 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 
785 aa  342  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.98 
 
 
853 aa  340  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
827 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
1068 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
907 aa  337  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.68 
 
 
973 aa  333  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
1313 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
940 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1199 aa  330  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
1195 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  45.72 
 
 
1028 aa  327  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
743 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
882 aa  326  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  40.45 
 
 
544 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
932 aa  323  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  38.81 
 
 
793 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
765 aa  320  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.75 
 
 
1007 aa  319  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
929 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
667 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.76 
 
 
661 aa  317  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
896 aa  317  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
865 aa  316  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
846 aa  316  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
1229 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 
969 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 
738 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.11 
 
 
1060 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
902 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.45 
 
 
631 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
916 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
944 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  37.16 
 
 
835 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  47.15 
 
 
666 aa  312  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  43.45 
 
 
1023 aa  312  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  44.53 
 
 
606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.94 
 
 
763 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1407 aa  310  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
1350 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
767 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
957 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  46.19 
 
 
559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.35 
 
 
995 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
1070 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
762 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.37 
 
 
860 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
604 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.24 
 
 
1362 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
1049 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1226 aa  303  9e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  45.26 
 
 
735 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
1116 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
1121 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 
1110 aa  301  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  41.83 
 
 
641 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 
785 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  42.27 
 
 
589 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
1596 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1029 aa  300  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
873 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
645 aa  300  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
945 aa  300  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
827 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.96 
 
 
659 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
524 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
791 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  45.38 
 
 
571 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1287 aa  299  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  43.47 
 
 
578 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0616  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
766 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0116444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1310 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
1350 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
924 aa  298  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
1222 aa  298  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
1135 aa  298  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
982 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  42.79 
 
 
1193 aa  297  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
1691 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
874 aa  297  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.14 
 
 
736 aa  297  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
803 aa  297  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
984 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1302 aa  296  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
1059 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
1120 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
1177 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
969 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>