More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2575 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 850 aa  1715    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 		 929 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  57.28 
 
 		 717 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 		 816 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 		 724 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  43.36 
 
 		 1135 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 718 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 833 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 977 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1069 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.06 
 
 		 1499 aa  361  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.66 
 
 		 923 aa  359  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.95 
 
 		 1053 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1369 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 921 aa  357  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.83 
 
 		 852 aa  349  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1692 aa  349  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 993 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 950 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 925 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 1245 aa  347  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1118 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.73 
 
 		 1331 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1040 aa  342  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1284 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 818 aa  340  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1245 aa  340  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 916 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 928 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1267 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1820 aa  338  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1326 aa  337  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 991 aa  337  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 1397 aa  336  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1384 aa  336  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 818 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  36.43 
 
 		 1021 aa  335  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  39.13 
 
 		 737 aa  333  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  35.95 
 
 		 1626 aa  332  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.24 
 
 		 1442 aa  331  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38 
 
 		 1177 aa  330  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1550 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1305 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 		 1398 aa  328  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1363 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1768 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1240 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 981 aa  327  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.65 
 
 		 2213 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 812 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 752 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1260 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 1014 aa  325  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1310 aa  323  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1771 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1767 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 936 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  37.6 
 
 		 1001 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1303 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1266 aa  322  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1072 aa  321  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.78 
 
 		 933 aa  321  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  39.25 
 
 		 1407 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 936 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1124 aa  320  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 778 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 1611 aa  319  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  42.59 
 
 		 977 aa  319  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1090 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1202 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1255 aa  318  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 682 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1426 aa  317  4e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1767 aa  318  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1767 aa  317  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1625 aa  317  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.79 
 
 		 932 aa  316  9e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1042 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 985 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1340 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 990 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 920 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.16 
 
 		 1765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 946 aa  315  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.97 
 
 		 765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 801 aa  314  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1240 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1659 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  36.82 
 
 		 1390 aa  314  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  37.41 
 
 		 750 aa  314  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 		 757 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 1959 aa  313  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.99 
 
 		 1683 aa  313  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1622 aa  313  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.91 
 
 		 1346 aa  313  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.4 
 
 		 1179 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>