More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0937 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  100 
 
 
852 aa  1733    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.8 
 
 
833 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 
816 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
916 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  42.49 
 
 
1135 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1202 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
1245 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
929 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1582 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  38.63 
 
 
1188 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 
1234 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
1236 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
1236 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
1236 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
1238 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.63 
 
 
1683 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  37.42 
 
 
1200 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
1238 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 
1230 aa  416  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1369 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 
1238 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1238 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.36 
 
 
2213 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.57 
 
 
2035 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1245 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.52 
 
 
1331 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.03 
 
 
1765 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
1234 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
1310 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
1767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
1340 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
1767 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
812 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1128 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1069 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  39.74 
 
 
1030 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1326 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1767 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1771 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  37.06 
 
 
1236 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
1765 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
1782 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.52 
 
 
1233 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1786 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1784 aa  396  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
1611 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  39.4 
 
 
1763 aa  395  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 
1236 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1792 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
1768 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 
1267 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
977 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1788 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
758 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1550 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1245 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
946 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
1165 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1266 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
920 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1314 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
1574 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
1033 aa  379  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
1363 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
1548 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
921 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
1397 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.88 
 
 
981 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
2654 aa  376  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
928 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
1284 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
1118 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 
1040 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.59 
 
 
1442 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
1398 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.75 
 
 
1177 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1622 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
957 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1240 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
682 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 
1313 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  36.1 
 
 
1439 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  39.21 
 
 
1346 aa  361  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.66 
 
 
1499 aa  360  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 
1303 aa  360  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1820 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 
830 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  39.53 
 
 
1297 aa  356  7.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1303 aa  356  7.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  40.49 
 
 
1407 aa  356  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
1433 aa  356  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  38.36 
 
 
1014 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.85 
 
 
858 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  39.69 
 
 
1390 aa  354  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40.57 
 
 
1053 aa  354  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1255 aa  353  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
950 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
925 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  40.48 
 
 
847 aa  353  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>