More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5275 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 830 aa  1650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1820 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 1305 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.81 
 
 		 950 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.81 
 
 		 925 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 1313 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 936 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1384 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  39.05 
 
 		 1135 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 801 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 		 758 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1550 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 887 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 		 812 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 1284 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1326 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1069 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 1397 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.71 
 
 		 1499 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  41.21 
 
 		 1407 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 682 aa  366  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1369 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1692 aa  365  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.57 
 
 		 1763 aa  364  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 		 921 aa  363  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 946 aa  363  9e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  41.74 
 
 		 852 aa  359  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.91 
 
 		 1346 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 		 977 aa  357  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 1767 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 1765 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1767 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 1767 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.46 
 
 		 1118 aa  354  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 833 aa  352  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1768 aa  351  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1040 aa  351  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1782 aa  349  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1771 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.67 
 
 		 1014 aa  346  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 929 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  39.12 
 
 		 1765 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 818 aa  346  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  39.31 
 
 		 1574 aa  345  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  40.73 
 
 		 1030 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 985 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 916 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 1786 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 1398 aa  344  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 816 aa  343  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1784 aa  344  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 		 1267 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 818 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.01 
 
 		 1683 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 1363 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1792 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.65 
 
 		 923 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 1124 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1611 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 876 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 957 aa  337  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.37 
 
 		 1442 aa  336  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1340 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1245 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.05 
 
 		 1177 aa  333  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 1033 aa  332  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 745 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.03 
 
 		 2213 aa  331  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 1245 aa  330  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1548 aa  330  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1230 aa  330  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.27 
 
 		 1331 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 1433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  37.2 
 
 		 1200 aa  328  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1202 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 1255 aa  327  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1310 aa  327  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 1266 aa  326  9e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 1234 aa  326  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1245 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 		 990 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 920 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1309 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  41.67 
 
 		 977 aa  324  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  40.33 
 
 		 847 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1234 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 1130 aa  323  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1622 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.12 
 
 		 1287 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.5 
 
 		 1109 aa  320  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.29 
 
 		 1179 aa  320  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 835 aa  320  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1238 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.8 
 
 		 649 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1238 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1238 aa  318  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1128 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 928 aa  317  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1238 aa  317  8e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1072 aa  316  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>