More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4113 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 801 aa  1577    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 925 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.92 
 
 		 950 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1820 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 		 936 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 1384 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1305 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1069 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 		 887 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.45 
 
 		 1135 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1326 aa  434  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 1240 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 		 812 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 1118 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 1369 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 		 1692 aa  431  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 		 1433 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  45.78 
 
 		 1346 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1548 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  48.13 
 
 		 758 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  43.13 
 
 		 1407 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 		 977 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.72 
 
 		 1442 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 1130 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 705 aa  416  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 916 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 		 816 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 		 1397 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 946 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 1124 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.11 
 
 		 2213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 1202 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1255 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 929 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1313 aa  406  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 		 1363 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 1611 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 		 682 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 921 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1284 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 		 1040 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1267 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 1072 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 1683 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 1398 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 1014 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 818 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1245 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  38.02 
 
 		 1001 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1480 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.11 
 
 		 1499 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1245 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 1765 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.29 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1165 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 1768 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1767 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.22 
 
 		 1468 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1771 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.98 
 
 		 1765 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  43.41 
 
 		 1763 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1767 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1767 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.42 
 
 		 1331 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 1622 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.97 
 
 		 833 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 993 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1033 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 835 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 920 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 1166 aa  366  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1582 aa  365  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 1090 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  42.73 
 
 		 847 aa  361  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 2654 aa  361  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1784 aa  360  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 957 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  41.07 
 
 		 750 aa  359  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.13 
 
 		 852 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 1786 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1128 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 1574 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.56 
 
 		 2035 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 		 1131 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  37.09 
 
 		 1179 aa  357  5.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 1230 aa  356  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.63 
 
 		 923 aa  356  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1782 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 912 aa  355  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1340 aa  354  4e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1193 aa  353  8e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 991 aa  352  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 990 aa  352  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1691 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1287 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1310 aa  351  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>