More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0277 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
957 aa  1857    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
925 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
950 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1820 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
936 aa  393  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
1305 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
946 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
1069 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
921 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
1550 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.29 
 
 
1346 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1369 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
770 aa  361  5e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
1130 aa  358  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  38.25 
 
 
1001 aa  353  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 
1442 aa  352  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
816 aa  352  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.83 
 
 
1109 aa  350  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
1384 aa  350  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
682 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1202 aa  348  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
1131 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 
916 aa  341  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  43.94 
 
 
847 aa  340  7e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  39.92 
 
 
750 aa  340  8e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.81 
 
 
1322 aa  339  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
977 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.01 
 
 
923 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.24 
 
 
1014 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
801 aa  338  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1005 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 
1126 aa  334  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
812 aa  333  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
1397 aa  333  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.57 
 
 
1763 aa  332  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.95 
 
 
1177 aa  332  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.69 
 
 
1574 aa  330  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 
1124 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  34.78 
 
 
1214 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
830 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
929 aa  327  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1398 aa  327  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.59 
 
 
1331 aa  327  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1582 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.47 
 
 
1179 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1767 aa  326  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
1064 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1310 aa  325  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1771 aa  325  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1767 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
1128 aa  325  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  38.02 
 
 
1407 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1255 aa  324  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1768 aa  324  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1240 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  40.98 
 
 
1135 aa  322  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1363 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
1118 aa  320  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 
1433 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.54 
 
 
1765 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.1 
 
 
758 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  40.82 
 
 
977 aa  320  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
912 aa  319  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1033 aa  318  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1009 aa  318  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  37.16 
 
 
765 aa  318  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1040 aa  318  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
1267 aa  317  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
1193 aa  317  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
1266 aa  317  8e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1765 aa  317  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1767 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
752 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
1326 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
835 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
778 aa  314  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
705 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.58 
 
 
1287 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
887 aa  313  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.45 
 
 
2213 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  34.52 
 
 
917 aa  313  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1165 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1284 aa  312  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1090 aa  312  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  38.2 
 
 
1030 aa  311  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1313 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1692 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1240 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1611 aa  311  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
757 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.98 
 
 
1683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
833 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
1016 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 
745 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.48 
 
 
852 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
876 aa  307  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
964 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
917 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
849 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  36.33 
 
 
761 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>