More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0437 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1130 aa  2273    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.31 
 
 		 1124 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1069 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1369 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 1550 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 921 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1820 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 950 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 925 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 929 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1384 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.75 
 
 		 1177 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.15 
 
 		 1014 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 977 aa  389  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 946 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 		 758 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  39.43 
 
 		 1407 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.57 
 
 		 1346 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 957 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 816 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 936 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 1548 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1326 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 		 812 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  43.15 
 
 		 847 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 1363 aa  363  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1072 aa  361  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.33 
 
 		 916 aa  360  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1245 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.68 
 
 		 1331 aa  359  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1240 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.03 
 
 		 1135 aa  358  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 		 1683 aa  357  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 1090 aa  357  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.04 
 
 		 1499 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1310 aa  352  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  39.45 
 
 		 977 aa  351  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1305 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.78 
 
 		 1765 aa  351  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1611 aa  351  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1771 aa  351  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 985 aa  350  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1768 aa  350  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1284 aa  350  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 705 aa  350  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.21 
 
 		 923 aa  349  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1767 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1118 aa  349  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1767 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 		 682 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 1767 aa  348  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 		 1763 aa  348  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 1433 aa  347  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1582 aa  346  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.07 
 
 		 2213 aa  344  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 1245 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1782 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1786 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1784 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1016 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1313 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 1574 aa  338  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1340 aa  336  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1765 aa  337  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 957 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.96 
 
 		 933 aa  335  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  37.17 
 
 		 750 aa  335  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1792 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1165 aa  334  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1333 aa  334  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 835 aa  334  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 		 1397 aa  334  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 1240 aa  333  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1128 aa  333  9e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1258 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 956 aa  333  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1040 aa  332  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1202 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 833 aa  332  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.63 
 
 		 1442 aa  332  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 830 aa  331  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.09 
 
 		 1322 aa  331  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.64 
 
 		 852 aa  331  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 993 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.52 
 
 		 929 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 887 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1193 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1622 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  37.07 
 
 		 765 aa  328  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1033 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1692 aa  326  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.27 
 
 		 1030 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1398 aa  325  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 1005 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1266 aa  325  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.54 
 
 		 2035 aa  325  3e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.91 
 
 		 929 aa  325  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 		 1275 aa  325  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.46 
 
 		 1053 aa  324  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>