More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0092 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1313 aa  2662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1363 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 		 1820 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 		 950 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 		 925 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 		 936 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 682 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 916 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1384 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  46.44 
 
 		 1407 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 1255 aa  399  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 		 1305 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1369 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1622 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 830 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1765 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1069 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1767 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1767 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 758 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 887 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 		 1611 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.46 
 
 		 1135 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 1550 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 1326 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1767 aa  383  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 2654 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1782 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.36 
 
 		 2213 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 816 aa  380  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 		 1763 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1784 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 801 aa  376  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1768 aa  376  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 1771 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.11 
 
 		 1765 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 1398 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1480 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 1397 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  40.66 
 
 		 1014 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1548 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1267 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 876 aa  365  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.03 
 
 		 1442 aa  364  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.28 
 
 		 852 aa  363  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 1692 aa  362  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 946 aa  361  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1788 aa  361  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 812 aa  360  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1266 aa  359  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.89 
 
 		 1499 aa  358  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1340 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1230 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1284 aa  357  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1124 aa  357  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1118 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 1245 aa  355  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 920 aa  353  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 927 aa  353  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1245 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 1040 aa  353  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1234 aa  353  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  35.97 
 
 		 1200 aa  353  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 1238 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 1238 aa  353  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 1202 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 1238 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.56 
 
 		 1346 aa  352  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 1238 aa  352  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1165 aa  351  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 1033 aa  351  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1234 aa  350  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1309 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.1 
 
 		 818 aa  348  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.97 
 
 		 923 aa  348  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1128 aa  347  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  40.61 
 
 		 1188 aa  346  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.4 
 
 		 1331 aa  345  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1582 aa  345  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1236 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 1236 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1236 aa  346  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 993 aa  343  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 921 aa  343  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 985 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1245 aa  343  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.32 
 
 		 1236 aa  341  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 818 aa  341  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 1683 aa  340  9e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 929 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1090 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  34.17 
 
 		 1439 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1193 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 745 aa  338  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 928 aa  338  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 757 aa  335  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 885 aa  334  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.927565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1131 aa  335  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 770 aa  335  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>