More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0484 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 		 1397 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  100 
 
 		 1255 aa  2589    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  38.21 
 
 		 855 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1313 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.2 
 
 		 1026 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  38.77 
 
 		 1064 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1363 aa  356  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1069 aa  346  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1202 aa  340  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1397 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1374 aa  335  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  46.61 
 
 		 606 aa  335  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.92 
 
 		 2213 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 845 aa  327  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 1767 aa  320  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  33.55 
 
 		 1301 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 909 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  27.81 
 
 		 1364 aa  318  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1267 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1767 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1433 aa  315  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  37.01 
 
 		 823 aa  315  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1118 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.05 
 
 		 1442 aa  315  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.3 
 
 		 1765 aa  313  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 1369 aa  312  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 1771 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.73 
 
 		 1177 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1303 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1767 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 874 aa  308  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  26.54 
 
 		 842 aa  307  9.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 928 aa  304  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 1326 aa  301  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  34.55 
 
 		 1322 aa  301  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 833 aa  300  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.4 
 
 		 1346 aa  300  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 758 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  33.1 
 
 		 938 aa  298  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 793 aa  296  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  37.33 
 
 		 1309 aa  296  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 921 aa  296  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1550 aa  295  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 816 aa  295  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.42 
 
 		 923 aa  294  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.46 
 
 		 1135 aa  293  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1266 aa  293  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.37 
 
 		 1763 aa  292  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  35.63 
 
 		 847 aa  292  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1611 aa  291  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1692 aa  290  9e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1820 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  29.16 
 
 		 1353 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 929 aa  290  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 1768 aa  289  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 1040 aa  289  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 950 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.95 
 
 		 2035 aa  289  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 925 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  28.98 
 
 		 1021 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1305 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1245 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 812 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 990 aa  284  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1169 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 1109 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1490 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.56 
 
 		 977 aa  283  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1131 aa  284  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 1485 aa  282  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1398 aa  281  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 835 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 782 aa  281  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1158 aa  280  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1659 aa  280  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 936 aa  279  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1788 aa  279  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 818 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 946 aa  278  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 1480 aa  278  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.05 
 
 		 1439 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 985 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.06 
 
 		 1499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1042 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1691 aa  275  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 847 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 		 1090 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1005 aa  274  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 818 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1072 aa  273  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 967 aa  272  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1255 aa  272  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 1291 aa  271  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  34.16 
 
 		 1122 aa  272  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  33.14 
 
 		 750 aa  271  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1236 aa  271  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 1141 aa  271  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.17 
 
 		 852 aa  271  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1234 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>