More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2460 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  100 
 
 		 606 aa  1239    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  46.61 
 
 		 1255 aa  335  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 1015 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.14 
 
 		 1054 aa  266  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  34.08 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.35 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.55 
 
 		 654 aa  256  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 869 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.6 
 
 		 639 aa  246  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  41.89 
 
 		 847 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 869 aa  243  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  40.24 
 
 		 1036 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  48.4 
 
 		 583 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  39.32 
 
 		 1037 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3034  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  40.18 
 
 		 929 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124331  unclonable  0.00000356382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  42.51 
 
 		 656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 738 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 		 519 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 591 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  45.56 
 
 		 703 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  36.34 
 
 		 523 aa  232  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  44.94 
 
 		 1301 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 368 aa  231  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  33.82 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  38.36 
 
 		 842 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 		 483 aa  228  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  45.72 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  39.87 
 
 		 1026 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  46.8 
 
 		 496 aa  219  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 763 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  39.52 
 
 		 683 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 763 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 763 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.94 
 
 		 639 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  46.94 
 
 		 794 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 859 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  45.27 
 
 		 770 aa  213  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 604 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  45.12 
 
 		 616 aa  211  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  48.45 
 
 		 614 aa  210  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  41.74 
 
 		 523 aa  210  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 616 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 1224 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  44.4 
 
 		 749 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  45.93 
 
 		 499 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  39.29 
 
 		 762 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  45.31 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 717 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 1354 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 594 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 915 aa  203  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  45.42 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 798 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  44.49 
 
 		 498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  47.03 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 719 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 810 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  45.76 
 
 		 255 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 763 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  41.06 
 
 		 524 aa  200  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  42.97 
 
 		 558 aa  200  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 779 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 807 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 717 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3794  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.09 
 
 		 915 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 965 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  42.44 
 
 		 671 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 778 aa  197  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 656 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 556 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  41.3 
 
 		 540 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4824  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  40.48 
 
 		 717 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 		 363 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  42.45 
 
 		 733 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  44.54 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 857 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 717 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 717 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 717 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 718 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 717 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 458 aa  190  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 717 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  42.92 
 
 		 418 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 628 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>