More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3330 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  76.99 
 
 		 717 aa  1170    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.57 
 
 		 717 aa  1162    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  74.69 
 
 		 717 aa  1140    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 717 aa  1483    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  76.85 
 
 		 717 aa  1165    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.27 
 
 		 717 aa  1176    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  54.73 
 
 		 683 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  78.24 
 
 		 719 aa  1184    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.62 
 
 		 717 aa  1156    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.2 
 
 		 717 aa  1153    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  36.21 
 
 		 842 aa  299  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.38 
 
 		 873 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 831 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 1255 aa  242  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 965 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 662 aa  237  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 496 aa  238  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 374 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  37.61 
 
 		 425 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 869 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  35.53 
 
 		 723 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 723 aa  228  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 723 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 821 aa  228  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 821 aa  228  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 821 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 723 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  37.61 
 
 		 425 aa  227  7e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.72 
 
 		 654 aa  225  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  34.67 
 
 		 812 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 695 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 757 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 562 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 869 aa  221  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.86 
 
 		 1054 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.98 
 
 		 639 aa  210  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.57 
 
 		 1301 aa  203  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0114339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2460  histidine kinase  36.94 
 
 		 606 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 656 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 502 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1267 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1383 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 732 aa  194  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2249  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  31.36 
 
 		 908 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  41.48 
 
 		 594 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 368 aa  193  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  43.69 
 
 		 816 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  43.24 
 
 		 816 aa  186  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1237 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  32.38 
 
 		 1026 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 763 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 763 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 763 aa  184  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 1015 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 484 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 713 aa  180  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1411  diguanylate cyclase  32.1 
 
 		 656 aa  177  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3250  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.79 
 
 		 1036 aa  174  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3146  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 521 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  37.88 
 
 		 847 aa  173  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1141  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 718 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 769 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 490 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  27.54 
 
 		 1037 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 518 aa  162  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 952 aa  159  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3794  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  28.25 
 
 		 915 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3975  GGDEF  29.59 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.456822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 		 1560 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 712 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 1144 aa  151  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3034  putative diguanylate cyclase (GGDEF)/ phosphodiesterase (EAL) with PAS/PAC and Chase sensors  26.65 
 
 		 929 aa  151  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124331  unclonable  0.00000356382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 887 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 677 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  24.15 
 
 		 768 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 488 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5522  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  26.87 
 
 		 1076 aa  147  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 499 aa  146  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3795  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 665 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 		 1426 aa  146  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 413 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 979 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 704 aa  144  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2165  histidine kinase  35.75 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11588  two-component sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 403 aa  143  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  34.71 
 
 		 564 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 377 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 529 aa  142  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 770 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 458 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 681 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  24.21 
 
 		 1287 aa  140  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>