More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5224 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5224  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 374 aa  754    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  93.05 
 
 		 422 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5027  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 1383 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 508 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  39.83 
 
 		 683 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 717 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 719 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 717 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 717 aa  239  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  37.85 
 
 		 717 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3605  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.57 
 
 		 873 aa  237  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 717 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 717 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 717 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 717 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1808 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 831 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 445 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 506 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 896 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 695 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1223 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 562 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1020 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 		 757 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 881 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2524  hypothetical protein  42.15 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2377  hypothetical protein  41.8 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 1068 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  33.83 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 1297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 1267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 922 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  43.35 
 
 		 594 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 931 aa  192  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2786  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 496 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00094173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  32.75 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  39.18 
 
 		 816 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 1118 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  38.78 
 
 		 816 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.85 
 
 		 796 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 662 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1002 aa  182  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 478 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2165  histidine kinase  39.92 
 
 		 489 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 798 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3546  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.69 
 
 		 803 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  59.69 
 
 		 792 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 769 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.328064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 1043 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 809 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 960 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29 
 
 		 1499 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 683 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 576 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.4 
 
 		 798 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 761 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1562 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  29.47 
 
 		 1303 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 929 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 678 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  58.33 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 1669 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 952 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 708 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 1177 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  30.11 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 732 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 		 696 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  34.17 
 
 		 812 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 639 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  32.55 
 
 		 723 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 628 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  32.55 
 
 		 723 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 1267 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  32.55 
 
 		 723 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  32.55 
 
 		 723 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 632 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  32.72 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.89 
 
 		 1015 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1144 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 712 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 704 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  31.13 
 
 		 632 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 502 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 618 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 606 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 1064 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 1331 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  57.38 
 
 		 446 aa  152  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 781 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 632 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>