More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3613 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1808 aa  3711    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.69 
 
 
1297 aa  562  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.09 
 
 
1002 aa  561  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.91 
 
 
1331 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.98 
 
 
708 aa  540  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.69 
 
 
796 aa  530  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.2 
 
 
934 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
1478 aa  503  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.97 
 
 
1081 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1501 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.9 
 
 
865 aa  483  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1548 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 
955 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.15 
 
 
680 aa  453  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
696 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
1391 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.94 
 
 
1068 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.62 
 
 
1419 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 
720 aa  434  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.15 
 
 
1431 aa  433  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.59 
 
 
1965 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
1714 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.96 
 
 
701 aa  430  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.64 
 
 
1557 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.17 
 
 
889 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1184 aa  417  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1330 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.35 
 
 
628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
882 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
606 aa  393  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.82 
 
 
1399 aa  388  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  50.24 
 
 
1407 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
653 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.61 
 
 
1287 aa  377  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 
697 aa  367  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  39.82 
 
 
678 aa  363  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  53.47 
 
 
732 aa  357  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
2693 aa  356  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1223 aa  348  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 
662 aa  348  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
657 aa  337  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  50 
 
 
459 aa  335  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  45.98 
 
 
519 aa  333  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
657 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 
585 aa  327  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  44.31 
 
 
1131 aa  323  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  44.7 
 
 
725 aa  321  9e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
1559 aa  319  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
930 aa  319  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 
587 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
663 aa  313  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
678 aa  312  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
631 aa  312  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  42.86 
 
 
676 aa  303  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.82 
 
 
1214 aa  301  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
794 aa  300  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
794 aa  300  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.99 
 
 
646 aa  296  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
1255 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
660 aa  296  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.67 
 
 
1220 aa  294  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
653 aa  293  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
761 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
689 aa  289  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.28 
 
 
1380 aa  289  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
761 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
656 aa  283  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
663 aa  283  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
558 aa  282  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1021 aa  282  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  36.53 
 
 
558 aa  281  9e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
835 aa  280  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
666 aa  280  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
666 aa  280  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  31.57 
 
 
1384 aa  278  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.98 
 
 
1408 aa  274  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  37.61 
 
 
796 aa  272  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  36.53 
 
 
769 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
1406 aa  270  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
781 aa  269  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  36.44 
 
 
771 aa  268  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  36.44 
 
 
771 aa  268  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
771 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
771 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
771 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
772 aa  266  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1085 aa  264  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
768 aa  263  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
754 aa  261  9e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.22 
 
 
1371 aa  261  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
664 aa  261  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
816 aa  259  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
663 aa  259  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
776 aa  259  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
652 aa  259  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
770 aa  259  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
799 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.79 
 
 
1361 aa  256  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
652 aa  256  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
672 aa  256  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>