More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1458 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
585 aa  1196    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  37.21 
 
 
1131 aa  359  7e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.78 
 
 
865 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.19 
 
 
1478 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
701 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1184 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 
1557 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
955 aa  330  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1287 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
934 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
708 aa  319  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  45.91 
 
 
1399 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
1297 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
696 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 
796 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1431 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1965 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
628 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.06 
 
 
1002 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 
1808 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.69 
 
 
889 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
1331 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.41 
 
 
1407 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
1501 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
720 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
606 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
1330 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
697 aa  300  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1419 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
1391 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
680 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
882 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
519 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
678 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
631 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.84 
 
 
1068 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
653 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
1548 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  41.38 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  38.54 
 
 
725 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
653 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  38.94 
 
 
678 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.8 
 
 
676 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
663 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
587 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
660 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
662 aa  257  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
656 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
672 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
666 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
666 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
768 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
781 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
654 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.31 
 
 
1214 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
663 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
664 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
794 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  36.27 
 
 
769 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
794 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.56 
 
 
1220 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
770 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  36.09 
 
 
771 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  36.09 
 
 
771 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 
771 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 
771 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 
772 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 
771 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  37.81 
 
 
796 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
768 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
768 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
768 aa  237  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
799 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.41 
 
 
1384 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
1018 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
1021 aa  230  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
835 aa  230  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
646 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
657 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
652 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
696 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
657 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
652 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
689 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
663 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1054 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
526 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
540 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.07 
 
 
1408 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
703 aa  216  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.42 
 
 
1380 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
755 aa  213  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
866 aa  213  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
869 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
816 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.07 
 
 
1361 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
730 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  34.29 
 
 
742 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
806 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>